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嗜酸热硫化叶菌LH1菌株基因组测序揭示极端酸性火山环境下的生物催化潜能
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月19日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7
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来自智利的研究团队针对极端酸性火山环境中嗜酸热硫化叶菌(Alicyclobacillus acidocaldarius)的生物催化特性展开研究,成功完成LH1菌株的基因组测序。该菌株分离自安第斯山脉pH 2.5的硫气孔,基因组分析发现其携带endoIII、endoIV等耐热核酸酶及5种CRISPR-Cas系统,为工业酶制剂开发提供新资源。
在智利安第斯山脉"Los Hoyos"硫气孔区(坐标-35.9525464, -70.7058126),研究人员从67.6℃、pH 2.5的蒸汽土壤中分离出一株嗜酸热硫化叶菌(Alicyclobacillus acidocaldarius)LH1。采用DSMZ Medium 88培养基(含[NH4
]2
SO4
1.30 g/L等成分)进行富集培养后,通过Illumina NovaSeq 6000平台完成基因组测序。
组装获得的2.6 Mb基因组(GC含量63.5%)包含170个contig,注释到2529个编码基因。特别值得注意的是,该菌株携带endoIII(EC 4.2.99.18)、endoIV(EC 3.1.21.2)和endoQ三种具有生物技术应用潜力的核酸酶基因,以及5套CRISPR-Cas防御系统。通过Roary软件进行的泛基因组分析显示,LH1菌株为该物种贡献了208个独特基因。
这项发现为开发耐高温工业催化剂提供了新的基因资源,特别是那些需要在极端酸性条件下保持活性的酶制剂。菌株中丰富的移动遗传元件(43个)和原噬菌体特征也暗示了其独特的基因组进化历程。
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