商业鱼类基因组学研究进展：文献计量与可视化分析揭示全球趋势与热点

本研究通过文献计量学方法，系统分析了2000-2023年商业鱼类基因组学领域的研究动态。研究人员利用Web of Science数据库收录的948篇文献，结合VOSviewer和CiteSpace可视化工具，揭示了该领域以中国和美国为主导的全球研究格局，识别出基因组选择(GWAS)、疾病抗性、CRISPR/Cas9基因编辑等核心热点，为水产养殖业的可持续发展提供了数据驱动的决策依据。

　　

随着全球人口增长和海洋资源枯竭，水产养殖已成为保障蛋白质供给的重要途径。然而传统育种方法效率低下，鱼类疾病频发等问题严重制约产业发展。在此背景下，基因组学技术为鱼类育种带来了革命性机遇，但该领域研究分散且缺乏系统性评估。

为厘清商业鱼类基因组学的研究现状，来自湖南岳麓山水产育种科技有限公司的研究团队开展了这项开创性的文献计量研究。通过分析2000-2023年间Web of Science核心合集收录的948篇文献，结合VOSviewer和CiteSpace等可视化工具，首次全景式描绘了该领域的发展轨迹。研究发现全球年发文量呈指数增长，中国以414篇发文量领先，但美国论文影响力更胜一筹（5906次引用）。研究识别出基因组选择(GWAS)、CRISPR/Cas9基因编辑、疾病抗性机制等前沿热点，并预测人工智能与基因组学的融合将推动精准水产养殖发展。

研究采用文献计量学(Bibliometric analysis)方法，通过Web of Science数据库检索策略获取948篇文献。使用Microsoft Excel分析年度发文趋势，VOSviewer构建国家/机构合作网络和关键词共现图谱，CiteSpace进行文献共被引分析和突现词检测。

3.1 总体发表趋势
数据显示商业鱼类基因组学研究可分为两个阶段：2008-2015年为缓慢发展期（年均23篇），2016年后进入爆发期（2021年达峰值）。这种增长趋势与二代测序(NGS)技术普及高度吻合。

3.2 国家/地区贡献
中国在发文量上占据绝对优势（45.4%），但美国论文篇均引用量更高（38.1次/篇）。国际合作网络分析发现形成了以中-美、中-日合作为核心的6大集群，欧洲国家间合作尤为紧密。

3.3 机构分析
中国机构包揽前十，其中农业农村部渔业渔政管理局（86篇）、中国水产科学研究院（78篇）和中国科学院（73篇）构成第一梯队。合作网络显示中国科研机构已形成内部协作闭环，但国际联动有待加强。

3.5 高影响力作者
Xu P以25篇发文量居首，Liu ZJ的《Nature Communications》论文（215次引用）揭示了鲶鱼鳞片进化的分子机制。值得注意的是，高被引论文多聚焦基础生物学问题，如Near TJ等关于辐鳍鱼类系统发育的研究被引731次。

3.7 关键词分析
共现网络将49个高频词分为5类：红色集群关注"虹鳟鱼蛋白鉴定"等应用研究；蓝色集群突出"水产养殖"与"大西洋鲑"等产业问题；黄色集群的"转录组"和"生长"反映功能基因组学热点。突现词分析显示研究焦点从早期"线粒体基因组"转向"抗病机制"和"基因组编辑"等前沿方向。

4.2 研究热点
基因组选择(GWAS)和定量性状位点(QTL)定位已成为改良经济性状的主流策略。研究特别强调抗病育种突破，如通过RNA-seq技术解析免疫相关基因表达谱。CRISPR/Cas9技术的应用案例显示，基因编辑鲤鱼肌肉生长抑制素基因可显著提升生长速度。

这项研究首次通过大数据揭示了商业鱼类基因组学的演进规律：技术上从传统标记辅助选择迈向多组学整合；应用上从单一性状改良扩展到全产业链优化。尽管中国在论文数量上领先，但需要提升基础研究的原创性和国际显示度。随着基因编辑监管框架的完善，该领域有望培育出抗病、速生的新品种，为全球粮食安全提供科技支撑。研究建议加强跨国合作，特别是将中国的育种规模优势与欧美的技术创新能力相结合，共同应对气候变化下的水产养殖挑战。