综述:CRISPR/Cas与SERS的协同整合:迈向实际应用的共赢策略

【字体: 时间:2025年06月18日 来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry 11.8

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  这篇综述系统阐述了CRISPR/Cas基因编辑系统与表面增强拉曼光谱(SERS)技术的协同整合策略,重点探讨了二者在核酸超灵敏检测中的互补优势。CRISPR/Cas凭借高特异性靶向识别能力,结合SERS独特的指纹图谱(400-1800 cm?1 )和局域表面等离子共振(LSPR)效应,实现了无需核酸扩增(preamplification-free)的分子诊断平台构建,为病原体检测和单碱基突变分析提供了革新性解决方案。

  

Abstract
近年来,成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)及其关联核酸酶(Cas)系统已成为基因组编辑的强大工具。除编辑功能外,CRISPR/Cas系统因其高灵敏度和特异性,在分子诊断尤其是核酸检测领域引发广泛关注。表面增强拉曼光谱(SERS)技术依托等离子体纳米结构,凭借卓越的灵敏度和特征光谱带成为生物传感的重要方法。二者的整合催生了多种超灵敏检测策略,本文系统综述了该交叉领域的技术原理、应用进展与未来挑战。

Introduction
CRISPR/Cas系统源于原核生物适应性免疫机制,被誉为"基因剪刀",已广泛应用于基因修饰、表达调控和高灵敏度检测。与传统PCR技术相比,其优势在于操作简便、成本低廉且无需复杂设备。SERS技术则通过分子振动指纹(400-1800 cm?1
)实现痕量物质鉴定,便携式设备更适用于现场检测。二者的结合形成级联信号放大系统:CRISPR/Cas完成靶标精准识别后,SERS通过等离子体纳米结构产生增强效应,将检测限提升至单分子水平。

CRISPR/Cas系统
根据Cas效应蛋白差异,该系统可分为两大类六种类型。第一类(I、III、IV型)依赖多亚基复合物,第二类(II、V、VI型)则通过单一效应蛋白发挥作用。其中Cas9(II型)和Cas12/Cas13(V/VI型)因可编程性sgRNA设计,成为分子诊断的首选工具。

SERS技术
该技术核心在于局域表面等离子共振(LSPR)效应:当入射光与金/银纳米结构相互作用时,会产生电磁场增强效应,使吸附分子的拉曼信号放大106
-1014
倍。独特的"指纹区"光谱可实现多靶标并行检测,而功能化纳米探针(如免疫SERS标签)进一步提高了检测特异性。

应用进展
在新冠病毒检测中,CRISPR/Cas12剪切触发纳米粒子聚集,产生SERS信号变化,检测限达0.5拷贝/μL。肿瘤标志物分析方面,通过设计针对KRAS突变的sgRNA,实现了血清中0.01 fM突变DNA的检出。此外,该平台还可用于抗生素耐药基因筛查,较传统方法缩短检测时间80%。

挑战与展望
当前瓶颈包括纳米基底批次稳定性、复杂样本基质干扰等问题。未来发展方向聚焦于:①开发新型Cas变体(如mini-Cas)提升递送效率;②构建多功能SERS标签实现多重检测;③集成微流控技术实现全自动化检测。随着便携式拉曼设备的普及,该技术有望在基层医疗和现场快检中发挥更大价值。

Conclusions
CRISPR/Cas-SERS联用技术正推动分子诊断进入"精准+便携"的新纪元。通过持续优化信号转导机制与设备微型化,这一平台将在传染病防控、精准医疗和环境监测等领域展现变革性潜力。

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