基于DNA三角棱柱纳米结构与CRISPR/Cas12a的电化学生物传感器实现甲胎蛋白和miRNA 122的双重检测

【字体: 时间:2025年06月16日 来源:Biosensors and Bioelectronics 10.7

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  针对肝癌早期诊断中多标志物联合检测的难题,研究人员开发了一种基于DNA三角棱柱(DTP)纳米框架与CRISPR/Cas12a系统的电化学生物传感器,结合DNAzyme-HCR三重信号放大策略,实现了甲胎蛋白(AFP)和miRNA 122的高灵敏度检测。该传感器通过非特异性切割作用降低背景信号,检测限低至fM级别,临床样本验证显示其能有效区分健康人与肝癌患者,为肝癌诊断提供了新型多功能平台。

  

肝癌是全球癌症相关死亡的第四大原因,其中肝细胞癌(HCC)占原发性肝癌的75%-85%。早期诊断对提高患者生存率至关重要,但现有临床手段如影像学检查和肝活检存在成本高、侵入性强等局限。尽管甲胎蛋白(AFP)是常用血清标志物,但其单一检测假阳性率高;microRNA 122虽在HCC中表达显著降低,但传统检测方法如qPCR操作复杂。如何实现多标志物联合检测并提升灵敏度,成为突破临床瓶颈的关键。

四川大学的研究团队在《Biosensors and Bioelectronics》发表研究,构建了一种基于DNA三角棱柱(DTP)纳米结构和CRISPR/Cas12a系统的电化学生物传感器。该平台整合DNAzyme、杂交链式反应(HCR)与CRISPR/Cas12a三重放大策略,首次实现AFP和miRNA 122的双重检测。临床验证表明,其检测限分别达33 aM(miRNA 122)和0.33 pg/mL(AFP),并能有效区分健康人与HCC患者血清样本。

关键技术包括:1)DTP纳米框架的一步法自组装,提供稳定三维支撑界面;2)Mg2+
依赖性DNAzyme触发HCR级联反应;3)CRISPR/Cas12a对ssDNA的非特异性切割(trans-cleavage)实现信号转换;4)G-四链体(G4)/hemin复合物电化学信号输出。

研究结果

  1. DTP纳米结构的制备与表征
    通过TM缓冲液中三条ssDNA(T1-T3)的一步退火自组装形成DTP,原子力显微镜显示其高度约4 nm,刚性结构可减少非特异性吸附,其顶部ssDNA设计为G4/hemin信号单元锚定位点。

  2. DNAzyme-HCR-CRISPR/Cas12a级联放大机制
    靶标存在时释放Mg2+
    依赖性DNAzyme(S4),切割发夹DNA(H1)产生触发链C2启动HCR,长链HCR产物激活Cas12a对S6和DTP顶部ssDNA的非特异性切割,使G4/hemin复合物形成受阻,电流信号降低70%(vs空白)。

  3. 检测性能优化
    在0.1 M PBS(pH 7.4)含5 mM [Fe(CN)6
    ]3?/4?
    的体系中,差分脉冲伏安法(DPV)显示AFP和miRNA 122的线性范围跨越5个数量级,检测限比ELISA低100倍。交叉实验证实其对非靶标分子(如miRNA 21)无响应。

  4. 临床样本验证
    检测50例HCC患者和30例健康人血清,ROC曲线下面积(AUC)达0.98(AFP)和0.96(miRNA 122),与qPCR结果一致性达93%。

结论与意义
该研究通过DTP纳米框架的精确空间排布与CRISPR/Cas12a的高效切割能力,解决了传统传感器对核酸/蛋白标志物同步检测的兼容性问题。其创新性体现在:1)DTP有序结构提升CRISPR系统对ssDNA的切割效率;2)单一平台通过简单序列替换即可切换检测靶标;3)无需标记步骤降低检测成本。这种模块化设计为肝癌早诊提供了新范式,并可扩展至其他疾病标志物检测领域。Xuemei Zhang团队指出,未来通过集成微流控技术有望实现床边检测(POCT)应用。

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