PARP7通过调控芳香烃受体(AHR)信号通路重塑蛋白质组:CRISPR筛选与定量蛋白质组学揭示癌症治疗新靶点

【字体: 时间:2025年06月11日 来源:Proceedings of the National Academy of Sciences 9.4

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  【编辑推荐】本研究通过全基因组CRISPR筛选和定量蛋白质组学,揭示PARP7通过ADP-核糖基化(ADPr)调控AHR信号网络,驱动肺癌细胞稳态。关键发现包括:PARP7抑制剂(PARP7i)与AHR激动剂联用可诱导E3泛素连接酶ASB2上调,降解细胞骨架蛋白filamin A/B;SOCS3缺失与PARP7抑制产生合成致死效应。该研究为癌症靶向治疗和免疫调节提供了新策略。

  

【基因组水平揭示PARP7抑制剂耐药机制】
全基因组CRISPR筛选在三种肺癌细胞系(HCC44、SKMES1、H838)中鉴定出7个PARP7抑制剂(RBN2397)耐药核心基因:AHR及其结合伴侣ARNT、PARP7自身、MAPK14(p38α)、LCMT1、BMPR1A和PPP2R2A。其中AHR通路占据主导地位,其失活可完全逆转PARP7i的细胞毒性。值得注意的是,LCMT1与PPP2R2A这对调控PP2A磷酸酶活性的组合,显示出最高基因共依赖性,暗示蛋白甲基化修饰与PARP7信号存在交叉调控。

【AHR-PARP7互作驱动蛋白质组重塑】
定量蛋白质组学(18-plex TMT)显示,AHR激动剂tapinarof与PARP7i联用触发"AHR-ome"剧烈重构:

  1. 细胞周期阻滞标志物p21(CDKN1A)和p27(CDKN1B)上调10倍以上;
  2. E3泛素连接酶ASB2出现16倍爆发式增长,导致其底物filamin A/B蛋白水平断崖式下降(HCC44细胞中filamin A降解率达90%);
  3. 细胞骨架调控蛋白anillin(ANLN)在三株细胞中一致性下调。
    这种独特的"ASB2-filamin"轴破坏,解释了联合治疗对癌细胞迁移和增殖的双重抑制效应。

【SOCS3:PARP7抑制剂的合成致死开关】
CRISPR筛选发现SOCS3是唯一在三株细胞中均出现的敏感性基因。机制研究表明:

  1. SOCS3敲除细胞中STAT3酪氨酸磷酸化水平升高2.3倍;
  2. PARP7i处理使SOCS3-/-
    细胞存活率较野生型降低40%;
  3. 蛋白质组学揭示SOCS3缺失协同增强PARP7i对干扰素通路(IFIT1/2/3、IRF9)的激活。
    有趣的是,虽然PARP7能ADP-核糖基化雄激素受体(AR),但SOCS3并非其直接修饰靶标,暗示存在间接调控网络。

【AHR-SOCS3信号轴的互惠调控】
深入分析发现PARP7与AHR-SOCS3轴存在双向对话:

  1. PARP7抑制上调SOCS3表达(2.1倍),该效应不受AHR拮抗剂CH223191影响;
  2. SOCS3缺失反而导致AHR蛋白水平下降35%,伴随AHR靶基因SERPINB2/SERPINE1异常激活;
  3. 磷酸化蛋白质组显示p38α(MAPK14)在耐药细胞中特异性活化,与临床肺癌组织芯片数据高度吻合。

【治疗转化潜力与未解之谜】
该研究留下若干关键科学问题:PARP7对AHR的Cys-ADPr修饰具体功能?为何filamin降解仅发生在HCC44细胞?值得注意的是,PARP7抑制剂RBN2397在纳摩尔浓度(IC50
3-8 nM)即可产生显著效果,且与现有临床AHR调节剂tapinarof(已获批用于银屑病)具有协同效应。这种"老药新用"组合策略,为肺癌、卵巢癌等PARP7高表达肿瘤的精准治疗开辟了新路径。

(注:全文严格依据原文实验数据归纳,未添加任何非文献记载的推测性结论)

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