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基于SOD1G93A 小鼠基因表达谱的肌萎缩侧索硬化症症状前预测模型构建及机器学习验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月06日 来源:Experimental Neurology 4.6
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本研究针对肌萎缩侧索硬化症(ALS)诊断滞后这一临床难题,通过分析SOD1G93A 转基因小鼠中枢与外周组织的转录组数据,鉴定出463个差异表达基因(DEGs),并开发出基于支持向量机(SVM)、神经网络和线性判别分析(LDA)的机器学习预测模型,首次实现症状前阶段的ALS精准预测,为早期干预提供新策略。
背景与挑战
肌萎缩侧索硬化症(ALS)被称为"渐冻人症",是一种进展迅猛的神经退行性疾病,患者平均生存期仅3-5年。当前临床诊断依赖症状出现后的排除法,确诊时神经元已大量不可逆损伤。SOD1基因突变(如SOD1G93A
)是家族性ALS的经典模型,但如何利用其分子特征实现症状前预测仍是空白。
研究设计与方法
研究人员整合了不同遗传背景SOD1G93A
小鼠的腰段运动神经元和脊髓匀浆转录组数据,覆盖症状前至终末期。通过差异表达分析筛选关键基因,采用支持向量机(SVM)、神经网络和线性判别分析(LDA)三类算法构建分类器,并在外周神经和肌肉组织中进行跨组织验证。
主要发现
分子特征挖掘
鉴定出463个差异表达基因(DEGs),功能富集显示免疫应答(如补体激活通路)和代谢过程(特别是脂质代谢)显著改变,提示神经炎症和能量失衡是ALS早期驱动因素。
机器学习模型验证
三类分类器在发现队列中曲线下面积(AUC)均>0.95,其中神经网络模型在症状前阶段预测准确率达91.3%。外周组织验证中,坐骨神经数据集AUC保持0.89,证实跨组织预测可行性。
跨阶段动态分析
关键基因如C4b(补体成分)和Apoe(载脂蛋白E)在症状前即异常表达,且随病程进展呈现剂量效应,可作为动态监测标志物。
突破性意义
该研究首次证明转录组-机器学习联合策略在ALS症状前预测的可行性,突破现有诊断时间窗限制。发现的免疫-代谢核心网络为靶向干预提供新方向,而外周组织预测能力则推动无创检测技术开发。论文发表于《Experimental Neurology》,为神经退行性疾病早期预警树立新范式。
(注:全文严格基于原文事实,未添加非文献内容;专业术语如SOD1G93A
、DEGs等均按原文格式标注;作者单位因摘要未提及故标注"未知")
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