RNA关联CRISPR筛选技术ReLiC揭示人类细胞转录后调控网络新机制

【字体: 时间:2025年05月30日 来源:Nature Methods 36.1

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  来自国际团队的研究人员开发了ReLiC(RNA-linked CRISPR)高通量筛选平台,靶向2,092个RNA结合蛋白基因,系统解析RNA剪接、翻译(polysome)和降解(mRNA decay)的调控网络。该研究通过化学基因组学发现核糖体碰撞传感器GCN1在抗癌药高三尖杉酯碱(homoharringtonine)中的作用,为转录后调控与疾病治疗提供新视角。

  

RNA分子在细胞中经历精密的代谢调控舞蹈,数千种RNA结合蛋白共同参与这场生命活动交响乐。研究者开发的ReLiC(RNA-linked CRISPR)技术像一把分子手术刀,通过将Cas9、sgRNA和条形码报告基因整合到特定基因组位点,系统解剖了2,092个人类RNA相关基因的功能谜团。

当这项技术与多核糖体(polysome)分级技术联姻,科学家们捕捉到翻译效率调控的隐秘玩家,意外发现蛋白质稳态(proteostasis)与翻译机器的精妙联动。更精彩的是,亚型特异性ReLiC实验像高清显微镜般揭示了SF3B复合物亚基对内含子滞留(intron retention)和外显子跳跃(exon skipping)的差异化调控。

在化学基因组学探索中,研究团队用ReLiC破译了mRNA降解上游的翻译调控密码,并发现核糖体碰撞"警报器"GCN1在抗癌明星药物高三尖杉酯碱(homoharringtonine)治疗中的关键角色。这项研究不仅搭建起解码转录后调控网络的强大框架,更为白血病等疾病的治疗策略提供了全新分子靶点。

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