NXPE1通过乙酰化人类结肠中的唾液酸改变唾液酸糖组:揭示新型唾液酸O-乙酰转移酶家族

【字体: 时间:2025年05月28日 来源:Nature Communications 14.7

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  研究人员针对结肠组织mPAS(轻度高碘酸希夫)染色差异的遗传机制展开研究,通过全基因组测序和生化实验发现染色体11q23.2区域的NXPE1基因是调控唾液酸O-乙酰化的关键因子。该基因通过启动子SNP rs661946调控表达,其蛋白产物可体外催化唾液酸乙酰化,并影响SIGLEC-15结合。这一发现填补了唾液酸修饰基因空白,为炎症性肠病和结直肠癌研究提供新靶点。

  

研究背景与意义
自1946年高碘酸希夫(PAS)染色技术问世以来,病理学家一直利用其检测组织中的黏蛋白。唾液酸作为糖蛋白和糖脂的末端组分,其O-乙酰化修饰(通过mPAS染色可区分)在宿主-病原体互作和细胞分化中起关键作用。尽管已知CASD1是唯一被确认的人类唾液酸O-乙酰转移酶(SOAT),但结肠mPAS染色的遗传基础仍不明确。这种染色差异在亚洲与欧非人群中的分布规律,以及随年龄、炎症状态变化的特征,暗示存在未被发现的SOAT基因。

约翰霍普金斯大学医学院的研究团队通过多组学方法,首次揭示NXPE1是调控结肠唾液酸O-乙酰化的核心基因。该研究不仅解析了mPAS染色的分子机制,还发现NXPE1可能代表一个新的SOAT家族,相关成果发表于《Nature Communications》。

关键技术方法
研究采用21例结肠组织样本(8例mPAS阳性、8例阴性、5例嵌合体)进行全基因组测序(WGS),锁定染色体11q23.2区域;通过91例独立样本的靶向测序验证SNP rs661946的基因型-表型关联;利用免疫组化(IHC)和免疫荧光分析NXPE1蛋白表达;采用CRISPR-Cas9在LS180细胞系中敲入rs661946变异;通过高效液相色谱(HPLC)验证NXPE1对唾液酸(CMP-Neu5Ac)的乙酰化活性。

研究结果

全基因组测序锁定染色体11q23.2区域
对21例结肠样本的WGS分析发现,17个与mPAS表型完全匹配的SNP均位于染色体11q23.2(chr11:114,298,921-114,446,104)。该区域含NXPE1、NXPE4等4个蛋白编码基因,其中启动子SNP rs661946(距NXPE1转录起始位点6bp)在91例验证样本中与表型完美匹配(p<2.2×10-16)。

NXPE1结构与功能同源性分析
NXPE1含有与CASD1相同的催化基序(GDS和DXXH),其预测三维结构显示Ser355与His529形成氢键网络,类似于CASD1的活性中心。AlphaFold模型提示NXPE1属于GDSL/SGNH样酰基酯酶家族,与流感病毒SOAT具有相似催化机制。

蛋白表达与表型关联
免疫组化显示,rs661946 T/T纯合子(mPAS阳性)无NXPE1蛋白表达,而C/T杂合子中罕见mPAS阳性隐窝均缺失NXPE1。相反,NXPE4和CASD1的表达与mPAS无关。在20种唾液酸结合蛋白中,仅SIGLEC-15的免疫荧光与mPAS染色模式完全一致,提示O-乙酰化特异性调控其结合。

遗传操控验证机制
在Jurkat细胞中过表达NXPE1导致SIGLEC-15结合下降和唾液酸-Tn(sialyl-Tn)染色减弱。GTEx数据库显示rs661946连锁单倍型与NXPE1等位基因表达失衡相关(转录本减少25-50%)。通过CRISPR将LS180细胞(原为T/T纯合子)改为C/T或C/C基因型后,NXPE1蛋白表达上升且mPAS阳性细胞数显著减少(p<0.01)。

体外酶活验证
重组NXPE1(AA 60-547)在乙酰辅酶A存在时,能将CMP-Neu5Ac转化为9-O-乙酰化产物(保留时间~11分钟)。催化位点突变体(S355A)完全丧失活性,而D526A突变体活性部分保留。NXPE1对CMP-Neu5Gc的乙酰化活性较弱,提示底物偏好性。

结论与展望
该研究确立NXPE1为结肠mPAS染色的决定性基因,其通过启动子SNP rs661946调控表达,催化唾液酸O-乙酰化并影响SIGLEC-15识别。这一发现具有双重意义:

  1. 理论价值:NXPE1可能是新型SOAT家族的原型,其与CASD1的协同作用有待解析;
  2. 应用潜力:rs661946变异频率在亚洲人群较高(MAF=0.47),与炎症性肠病GWAS信号重叠,为疾病分层提供标记。此外,结直肠癌中11q23缺失可能导致唾液酸修饰丢失,或可开发SIGLEC-15靶向疗法。

研究局限性在于NXPE1确切修饰位点(如7-O或9-O乙酰化)及其组织特异性调控机制仍需深入探索。作者建议未来研究应关注NXPE家族其他成员(如NXPE4)在唾液酸修饰网络中的角色。

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