表没食子儿茶素没食子酸酯通过结合TDP-43的RNA识别基序抑制其聚集:为ALS治疗提供新策略

【字体: 时间:2025年05月24日 来源:Scientific Reports 3.8

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  本研究针对肌萎缩侧索硬化症(ALS)中TDP-43蛋白异常聚集的病理机制,通过多学科技术揭示了绿茶多酚EGCG通过特异性结合TDP-43的RNA识别基序(RRM1/RRM2),延缓其成核期聚集并形成非毒性寡聚体的分子机制。研究结合ThT荧光检测、NMR谱学和计算建模,首次阐明EGCG与RRM域的相互作用模式,为开发靶向TDP-43蛋白病的神经保护剂奠定理论基础。

  

研究背景与科学问题
肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)等神经退行性疾病的共同病理特征是TDP-43蛋白的细胞质异常聚集。作为核酸结合蛋白,TDP-43通过其N端结构域、两个RNA识别基序(RRM1/RRM2)和C端低复杂度区域参与RNA代谢。超过97%的ALS患者中,TDP-43会错误定位到细胞质并形成毒性聚集体,而RRM结构域已被证实含有淀粉样形成关键序列。尽管研究表明绿茶多酚EGCG可抑制多种致病蛋白(如α-突触核蛋白、亨廷顿蛋白)的聚集,但其对TDP-43 RRM结构域的作用机制尚不明确。

研究设计与技术方法
意大利Fondazione Ri.MED等机构的研究团队通过重组表达含RRM1-RRM2的TDP-43片段(K102-Q269),采用硫黄素T(ThT)荧光动力学监测EGCG对聚集动力学的影响,结合饱和转移差(STD)和转移核欧佛豪瑟效应(trNOE)核磁共振技术验证相互作用。利用RoseTTAFold预测RNA-free的RRMs三维结构,通过化学位移扰动(CSP)和HADDOCK分子对接定位结合位点,最后经100 ns分子动力学(MD)模拟评估复合物稳定性。

关键研究发现

  1. EGCG抑制TDP-43 RRMs体外聚集
    ThT实验显示,30 μM EGCG可使聚集成核期从10小时显著延长,且终点荧光强度降低60%。显微镜观察证实EGCG处理组淀粉样聚集体数量减少,表明其通过干扰早期寡聚化抑制纤维形成。

  2. EGCG与RRMs的直接相互作用
    STD-NMR检测到EGCG芳香环质子信号,trNOE谱显示结合态特征峰,证实两者存在弱结合(Kd~μM级)。

  3. RNA-free RRMs的结构特征
    RoseTTAFold模型显示,无RNA时RRM1-RRM2呈开放构象,14氨基酸连接区具有高柔性。温度系数分析(dδHN/dT < -5 ppb/K)验证该模型与溶液状态一致。

  4. 结合位点与作用机制
    CSP分析鉴定出RRM1(L111/D174/D185)和RRM2(D247/K263)关键结合残基。MD模拟揭示EGCG通过氢键(RRM1占据率78.59%)和π-π堆积(F147/F231)双重作用稳定RRMs,其中RRM1结合更稳固。

科学意义与展望
该研究首次阐明EGCG通过"双位点结合"模式(1:2化学计量)调控TDP-43 RRMs的构象动力学,提出"结构域特异性稳定"的新干预策略。值得注意的是,EGCG在还原剂(DTT)存在下才能维持活性,这解释了既往研究中化合物不稳定的矛盾结果。尽管EGCG对RRMs的亲和力较弱(毫摩尔级),但其多靶点特性(可同时作用于无序C端和结构化RRMs)为开发ALS/FTD的鸡尾酒疗法提供思路。未来需优化EGCG衍生物以提高血脑屏障穿透性和靶向性,并探索其与RNA竞争的生理相关性。

这项发表于《Scientific Reports》的工作将计算生物学(RoseTTAFold)、生物物理(NMR)和细胞病理学技术有机整合,为理解TDP-43相分离与聚集的分子开关提供了关键实验证据,也为天然产物在神经保护中的应用树立了机制研究的范式。

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