基于机器学习的小鼠厌恶反应自动量化研究

【字体: 时间:2025年05月22日 来源:Scientific Reports 3.8

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  为解决手动分析小鼠厌恶反应耗时费力且结果易受主观影响的问题,研究人员开展基于机器学习的厌恶反应自动量化研究。利用 DeepLabCut 和随机森林分类器,发现自动估算结果与手动计数高度相关(Pearson’s r=0.97),为大规模行为分析提供新方法。

  
在生命科学研究领域,情绪的神经机制解析一直是重要且充满挑战的方向。厌恶(Disgust)作为一种核心负性情绪,对于生物体抵御中毒和感染至关重要,其异常表现与癌症化疗副作用、进食障碍、强迫症等多种精神疾病密切相关。然而,由于厌恶是一种主观意识体验,无法直接观测,长期以来研究者依赖对啮齿类动物味觉反应(Taste Reactivity)中特定行为的手动分析来量化厌恶反应,如张嘴(Gape)、甩头(Head Shake)、洗脸(Face Wash)等。这种逐帧手动标注的方法不仅耗时耗力,还存在人为偏差和个体间一致性差的问题,严重制约了大规模行为学研究和长期实验的开展。

为突破这一技术瓶颈,日本东京科学大学(Institute of Science Tokyo)的研究人员开展了一项创新研究,旨在开发一种自动化的小鼠厌恶反应量化方法。相关成果发表在《Scientific Reports》上,为动物行为分析领域提供了重要的技术工具。

研究人员采用了深度学习与机器学习相结合的技术路线。首先利用 DeepLabCut(DLC)这一基于深度神经网络的无标记姿势估计技术,对小鼠的鼻子、左右前爪和左右后爪共 5 个身体部位进行坐标追踪。通过训练 DLC 模型,实现了对小鼠行为视频中身体部位的自动定位,平均误差小于 1 毫米,精度优于同类研究。随后,将自动追踪数据与手动标注的厌恶反应标签(包括是否发生反应及反应类型)相结合,构建了随机森林(Random Forest)分类器。通过特征工程提取了包括位移、距离变化等在内的 125 维几何特征,并利用 Boruta 算法进行特征选择,最终确定了以鼻尖与前爪位置关系为核心的关键特征组合。

研究结果


  1. 手动分析与自动化追踪的对比
    通过对 27 个视频的 97,200 帧进行手动标注,发现小鼠的厌恶反应主要表现为前肢挥舞(Forelimb Flail)、洗脸和 chin rub(下巴摩擦),而张嘴和甩头频率较低。传统手动分析需耗费大量人力,且不同观察者间存在数据差异,凸显了自动化方法的必要性。

  2. 随机森林分类器的性能
    分类器在测试集上的整体准确率达 95% 以上,对洗脸(灵敏度 0.65,阳性预测值 0.85)和前肢挥舞(灵敏度 0.55,阳性预测值 0.73)的检测表现良好。尽管对张嘴和甩头的检测能力有限(灵敏度为 0),但模型对总厌恶反应次数的预测与手动计数高度相关(Pearson’s r=0.97),验证了其可靠性。

  3. 特征重要性与模型泛化性
    特征重要性分析表明,前爪间距及鼻尖与前爪的距离是预测厌恶反应的关键指标。研究还发现,该模型可兼容低帧率(30 fps)视频和低成本设备,且仅需标注 5 个身体部位,显著降低了手动注释和计算资源的负担。


结论与讨论


这项研究首次实现了味觉反应测试中厌恶反应的自动化评估,解决了传统方法的主观性和效率瓶颈。通过结合 DeepLabCut 和随机森林算法,研究人员建立了一种可重复、高效的量化工具,适用于先天和习得性厌恶反应的大规模筛选,为神经科学、药理学和精神疾病研究提供了新范式。

尽管模型对高频微表情(如甩头)和口腔精细动作(如张嘴)的检测仍有局限,但通过增加追踪点或提高帧率有望改善。该方法的推广将加速厌恶情绪神经机制的研究,助力化疗副作用缓解、精神疾病病理解析及相关干预手段的开发。随着无标记姿势估计技术的进步,此类自动化行为分析工具将在生命科学领域发挥更广泛的作用,推动从分子机制到行为表型的跨尺度研究。

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