综述:解锁CRISPR相关转座子的潜力:从结构到功能的见解

【字体: 时间:2025年05月21日 来源:TRENDS IN Genetics 13.6

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  (编辑推荐)本综述系统阐述了CRISPR相关转座子(CASTs)作为新型基因组编辑工具的突破性进展。通过RNA引导实现无DNA双链断裂(DSBs)的大片段精准插入,其独特的转座机制(分Class 1/2两类)规避了传统CRISPR-Cas系统的局限性。结构生物学进展为优化CASTs在细菌及哺乳动物细胞中的应用提供了关键理论支撑,为合成生物学和基因治疗开辟了新路径。

  

Highlights

无断裂编辑的革命性突破
CRISPR相关转座子(CASTs)通过RNA引导实现DNA精准插入,完全规避了传统CRISPR-Cas系统依赖的双链断裂(DSBs)修复机制。这种特性使其在保留长片段DNA(如全长基因)整合能力的同时,显著降低了脱靶效应和细胞毒性。

分类与机制解析
CASTs根据CRISPR模块差异分为Class 1和Class 2:

  • Class 1采用多亚基复合物(如Cascade系统)识别靶位点

  • Class 2使用单一效应蛋白(如Tn7-like转座酶)
    冷冻电镜研究揭示了转座酶招募过程中关键界面残基的变构调控,为理性设计高特异性突变体提供了结构基础。

应用前景与挑战
在细菌中,CASTs已实现>10 kb外源DNA的高效整合(效率达80%)。但在哺乳动物细胞中仍面临染色质屏障和递送效率限制。最新工程化策略通过融合核定位信号(NLS)和染色质开放因子(如P300),使人类细胞插入效率提升3倍。

Abstract

CASTs代表了第三代基因组编辑技术的核心发展方向。其核心优势在于:

  1. 无需同源定向修复(HDR)即可完成精准插入

  2. 克服了碱基编辑器和Prime editors的尺寸限制

  3. 通过定向进化获得的突变体(如Tn5-CAST)展现出<0.1%的脱靶率
    目前研究重点聚焦于:

  • 开发哺乳动物特异的启动子系统

  • 优化转座子末端重复序列以增强整合可控性

  • 建立组织特异性递送方案(如AAV载体改造)
    这些进展将推动CASTs在镰刀型贫血症等遗传病治疗中的转化应用。

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