基于代谢组学揭示药物诱导心脏微组织结构性心脏毒性的预测性代谢特征

【字体: 时间:2025年05月18日 来源:Archives of Toxicology 4.8

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  为解决药物研发中心脏安全性问题,研究人员针对药物诱导的结构性心脏毒性(SCT),利用心脏微组织模型开展代谢组学研究。发现 Cer33:1;O2等 ceramides、能量代谢中间体等代谢特征可预测 SCT,为早期毒性预测提供新方向。

  
在药物研发的漫长征程中,心脏毒性如同潜伏的 “杀手”,常常导致候选药物在后期研发阶段折戟沉沙,不仅造成巨大的资源浪费,也让患者错失潜在的治疗希望。尤其是结构性心脏毒性(Structural Cardiotoxicity, SCT),其引发的心肌组织形态损伤难以在早期精准预测,成为制约安全有效药物开发的瓶颈。传统的体外检测方法,如基于二维单层细胞的实验,难以模拟体内复杂的细胞间相互作用和微环境,导致预测结果与临床实际存在偏差。因此,开发一种能够更真实反映人体心脏生理状态、精准预测 SCT 的方法,成为科学界和制药界的迫切需求。

为了攻克这一难题,英国伯明翰大学(University of Birmingham)的研究人员开展了一项具有突破性的研究。他们以人类相关的三维心脏微组织(Cardiac Microtissues)为模型,结合先进的代谢组学技术,深入探究药物诱导 SCT 的分子机制,并试图发现可用于预测 SCT 的代谢特征。这项研究成果发表在国际知名毒理学杂志《Archives of Toxicology》上,为药物心脏毒性的早期预测和评估提供了全新的视角和方法。

研究人员主要采用了以下关键技术方法:

  1. 三维心脏微组织模型构建:利用人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)与内皮细胞、成纤维细胞共培养,形成具有生理相关性的 3D 心脏微组织,模拟体内心脏的结构和功能。
  2. 代谢组学分析:通过直接进样质谱(nESI-DIMS)和超高效液相色谱 - 质谱(UHPLC-MS)技术,对细胞内极性代谢物、脂质提取物和培养液中的代谢足迹进行无靶向代谢组学分析,同时定量外源化合物及其生物转化产物。
  3. 多元统计分析:运用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)等方法,筛选出与 SCT 相关的代谢特征,并构建预测模型。

发现外源性化合物在心脏微组织中的命运


通过对 12 种外源性化合物(8 种临床认定的 SCT 药物和 4 种非心脏毒性药物)的定量分析发现,培养介质中的游离浓度普遍低于标称浓度,提示非特异性结合或吸附可能影响实际暴露剂量。此外,心脏微组织展现出 I 相代谢能力,检测到多种生物转化产物(BTPs),如拉帕替尼、甲苯咪唑和舒尼替尼的代谢产物,首次证实了该模型具有外源性化合物代谢能力,为体外 - 体内外推(IVIVE)提供了重要依据。

心脏微组织对药物暴露的代谢响应


暴露于 SCT 药物后,心脏微组织的细胞内代谢组和脂质组发生显著变化。甘油 - 3 - 磷酸乙醇胺水平降低,提示甘油磷脂代谢紊乱;Cer33:1;O2和 Cer43:2;O等神经酰胺(Ceramides)水平下降,暗示其在 SCT 发生中可能具有共性作用。相比之下,细胞外代谢足迹的扰动较小,突显了细胞内代谢测量在机制发现中的重要性。

预测药物诱导结构性心脏毒性的代谢特征


OPLS-DA 分析成功筛选出一组具有预测能力的代谢特征,包括 29 种细胞内神经酰胺、能量代谢中间体(如肌酸、ATP、ADP、AMP)、嘌呤代谢产物(如脱氧腺苷、肌苷)和氧化应激标志物(如谷胱甘肽)。这些特征不仅与已知的 SCT 机制(如线粒体功能障碍、氧化应激)相关,还揭示了神经酰胺信号通路在 SCT 中的新作用。此外,细胞外代谢物如乳酸、胸苷等也被发现具有预测价值,与先前研究结果相互印证。

研究结论与意义


本研究通过整合三维心脏微组织模型和代谢组学技术,首次全面揭示了药物诱导 SCT 的代谢特征。研究发现,心脏微组织的游离药物浓度与标称浓度存在显著差异,强调了在体外实验中进行实际浓度测量的必要性;其代谢能力的证实,提升了该模型在预测体内毒性中的转化相关性。

筛选出的代谢特征不仅涵盖了能量代谢、氧化应激等已知机制,还首次将神经酰胺信号通路与 SCT 关联,为深入理解 SCT 的分子机制提供了新靶点。这些发现为开发基于代谢生物标志物的 SCT 早期预测方法奠定了基础,有望在药物研发早期阶段剔除具有心脏毒性风险的候选药物,减少后期研发失败率,加速安全药物的开发进程。

值得注意的是,研究中建立的预测模型在多个时间点和分析平台上展现出稳定性,提示其具有潜在的临床应用价值。未来,进一步验证和优化这些代谢标志物,有望将其纳入药物安全评估的标准流程,推动毒理学研究向更精准、更高效的方向发展。

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