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肠道病毒 D 属(EV-D)对人类健康影响渐显,如 2014 年 EV-D68 引发严重呼吸窘迫等。本文研究发现,EV-D111 与其他 EV-D 成员类似,依赖唾液酸(Sias)进行最佳复制。该研究有助于理解 EV-D111 生物学特性及潜在威胁。
肠道病毒 D 属概述
肠道病毒(Enterovirus,EV)属于小核糖核酸病毒科(Picornaviridae),其基因组为单链正向 RNA。目前,肠道病毒属包含 15 个种,其中 7 种可感染人类。依据系统发育标准和分子分型方法,肠道病毒被分为不同的种和病毒型。
肠道病毒 D 属(Enterovirus D,EV-D)具有独特之处。其一,该属仅有 5 种血清型,而其他感染人类的肠道病毒种通常含有数十种血清型。其二,EV-D 成员的组织嗜性差异显著,例如 EV-D68 是呼吸道病毒,EV-D70 具有强烈的眼部嗜性,EV-D94、EV-D111 和 EV-D120 似乎主要在肠道中复制。其三,部分 EV-D 病毒的起源可能是人畜共患,像 EV-D70 在非洲引发急性出血性结膜炎大爆发前,已在 domestic animals 血清中检测到针对它的抗体;EV-D111 和 EV-D120 在非人类灵长类动物(non-human primates,NHPs)粪便中被发现,这表明它们可能源于动物。
研究背景与目的
此前研究表明,EV-D68、EV-D70 和 EV-D94 利用唾液酸(sialic acids,Sias)作为细胞附着因子。然而,关于 EV-D111 是否利用 Sias 尚不清楚。本研究旨在探究 Sias 在 EV-D111 感染过程中的作用,同时研究猿猴肠道病毒 EV-B114 对 Sias 的利用情况,以深入了解肠道病毒的感染机制和进化特征。
材料和方法
- 细胞和病毒:实验选用人类横纹肌肉瘤来源的 RD 细胞和恒河猴肾来源的 LLC-MK2 细胞。所用病毒包括 EV-D111、EV-D68、EV-D70、柯萨奇病毒 B3(Coxsackievirus B3,CVB3)以及猿猴肠道病毒 EV-B114。
- 病毒感染:在感染前一天,将 RD 细胞或 LLC-MK2 细胞接种于 12 孔板,次日用无血清接种物以不同感染复数(multiplicity of infection,MOI)感染细胞,孵育 1 小时后更换培养基,感染结束后经冻融和离心处理,收集细胞上清液储存于 -80°C。
- 去除细胞表面唾液酸:使用两种神经氨酸酶(neuraminidase,NA)处理细胞,一种可特异性去除 Sias α2,3,另一种可去除所有 Sias 亚型(α2,3、α2,6 和 α2,8),处理后进行病毒感染实验。
- 病毒滴定:采用 10 倍稀释法,将不同稀释度的病毒样本接种于 RD 细胞,培养 7 天后通过显微镜观察细胞病变效应(cytopathic effect,CPE),使用 Spearman-K?rber 方法计算半数组织培养感染剂量(median tissue culture infectious dose,TCID50)。
- RNA 提取和实时 RT-PCR 分析:使用 QIAamp Viral RNA Mini Kit 提取病毒 RNA,利用 TaqMan 实时 RT-PCR 技术定量病毒 RNA,通过标准曲线将阈值循环数(Ct)转换为等效 TCID50/mL。
- 构建敲除细胞系:利用 CRISPR-Cas9 技术,通过两对 sgRNAs 靶向 CMAS 基因的外显子 3 和外显子 8,构建 CMAS 基因敲除的 RD 细胞系,同时设置非靶向 gRNA 转导的细胞作为对照。
- 蛋白质免疫印迹(Western blot):裂解细胞后,进行蛋白质变性、电泳分离和转膜,依次用抗 CMAS 和抗 GAPDH 抗体孵育,再用二抗孵育,通过红外成像系统成像并定量蛋白质水平。
- 免疫荧光检测:感染细胞后固定、通透和封闭,用抗 VP1 和抗 dsRNA 抗体染色,再用二抗孵育,使用 Hoechst 染核,通过共聚焦显微镜成像并分析感染细胞比例。
- 病毒结合实验:将细胞接种于 12 孔板,部分细胞用 NA 处理,加入 EV-D111 后在冰上孵育,洗涤去除未结合病毒,提取 RNA 进行 RT-PCR 分析,评估病毒结合情况。
- 病毒 RNA 转染:先使用含纳米荧光素酶基因的体外转录本评估细胞转染效率,再将 EV-D111 病毒 RNA 转染至野生型(WT)和敲除(KO)细胞系,通过病毒滴定检测感染性病毒颗粒的产生。
实验结果
- EV-D111 利用唾液酸感染人类 RD 细胞:用 NA 处理细胞后,与未处理细胞相比,EV-D111 感染的 RD 细胞中病毒 RNA 产量和感染性病毒颗粒产生显著降低,与阳性对照 EV-D70 表现相似,而阴性对照 CVB3 不受影响,表明 EV-D111 感染依赖 Sias。构建 CMAS 基因敲除的 RD 细胞系,CMAS KO 细胞感染 EV-D111 后,病毒 RNA 产量和感染性病毒颗粒产生较对照细胞明显减少,且感染细胞比例降低,病毒结合量也减少,进一步证实 EV-D111 利用 Sias 感染人类 RD 细胞。
- EV-D111 似乎特异性结合 Sias α2,3 感染 RD 细胞:用特异性去除 Sias α2,3 的 NA(NA α2,3)和去除所有 Sias 亚型的 NA(NA α2,3-6-8)处理细胞后感染病毒,发现 EV-D111 与 EV-D70 类似,两种 NA 处理对其病毒产量影响无差异,而 NA α2,3-6-8 处理对 EV-D68 病毒产量影响更大,表明 EV-D111 主要利用 Sias α2,3 感染 RD 细胞。显微镜分析和病毒结合实验也证实,去除 Sias α2,3 显著降低 EV-D111 感染细胞比例和病毒结合量。
- 猿猴肠道病毒 EV-B114 的复制不依赖唾液酸:用 NA 处理 RD 细胞后感染 EV-B114,发现处理组和未处理组的病毒 RNA 产量和感染性病毒颗粒产生无显著差异。在 LLC-MK2 细胞中进行相同实验,结果显示 EV-D70 和 EV-D111 感染受 NA 处理显著抑制,而 CVB3 和 EV-B114 不受影响,表明 EV-B114 感染不依赖 Sias。对比 EV-Ds 和 EV-B114 的衣壳氨基酸序列,发现 EV-Ds 中与 Sias 相互作用的氨基酸在 EV-B114 中存在差异,如 VP1 蛋白序列有 9 个氨基酸缺失,其中包含 3 个与 Sias 结合相关的氨基酸,这可能是 EV-B114 不利用 Sias 的原因。
讨论
唾液酸在众多病毒的自然史中发挥重要作用,作为附着因子可帮助病毒跨越物种屏障。在肠道病毒属中,虽然利用 Sias 较为罕见,但已有研究表明 EV-D 属中多种病毒依赖 Sias。本研究发现 EV-D111 也利用 Sias 感染细胞,且主要结合 Sias α2,3,这一特性可能是 EV-D 属的祖先特征,并非细胞培养适应的结果。
EV-D 属病毒的组织嗜性和 Sias 结合偏好存在差异,且与病毒的系统发育关系不一致。例如,EV-D68 偏好 Sias α2,6,具有呼吸道嗜性;EV-D70 和 EV-D111 主要结合 Sias α2,3,分别引起眼部和肠道相关感染。推测 EV-D 属病毒最初可能具有肠道嗜性,通过改变 Sias 利用方式和跨越物种屏障,获得了更广泛的组织嗜性,从而对人类致病,如柯萨奇病毒 A24 变异株(CVA24v)获得结合 Sias α2,3 的能力后,引发急性出血性结膜炎。
EV-D111 和 EV-D120 在野生 NHPs 粪便中被发现,提示其可能存在人畜共患起源。然而,并非所有猿猴肠道病毒都利用 Sias,如 EV-B114 感染不依赖 Sias。对 EV-D111 的研究表明,其在人类中的传播有限,但随着城市化进程中人与野生灵长类动物接触增加,存在潜在的爆发风险。
综上所述,本研究认为 EV-D111 可能采用两步进入细胞的机制,首先结合 Sias α2,3 增加与受体接触概率,然后通过未知受体触发内吞和衣壳构象变化,释放病毒基因组。目前,EV-D111 的受体尚未明确,深入研究其感染机制对于理解病毒进化和潜在威胁至关重要。