QTL 定位与多组学技术助力挖掘大豆蛋白质和油脂关键候选基因,为大豆育种奠基
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时间:2025年05月13日
来源:Theoretical and Applied Genetics 4.4
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大豆种子中蛋白质和油脂的调控机制尚不明确。研究人员通过 QTL 定位、BSA-seq 和 RNA-seq 技术,检测出 37 个 QTLs,筛选出 12 个候选基因。该研究为大豆育种的候选基因研究和标记辅助选择(MAS)奠定基础。
蛋白质和油脂是大豆种子的两大主要经济成分。尽管已有一些调控大豆蛋白质和油脂积累的相关基因被报道,但调控机制在很大程度上仍不明确。在本研究中,研究人员利用长江春 2 号(高蛋白和高油含量)与榆树县 2 号(低蛋白和低油含量)杂交产生的四代植株进行数量性状位点(QTL)定位,共检测到 37 个 QTL,其中 16 个与蛋白质含量相关,21 个与油脂含量相关。
对 F2群体个体的两个亲本和两个后代极端池进行了混合分组分析测序(BSA-seq)。发现两个 QTL,即 qOIL1.2 和 qPRO14.1,与 BSA-seq 的定位区间重叠,在这两个区间内,有 8 个基因的编码序列(CDS)存在单核苷酸多态性(SNPs)或插入缺失(InDel)变异。
对 F2:3群体个体的两个极端池在授粉后 20 天、30 天和 40 天采集的种子进行 RNA 测序(RNA-seq),在 QTL 区域内共获得 199 个差异表达基因(DEGs)。结合以往研究,10 个蛋白质相关和 4 个油脂相关的 QTL 区间与之前鉴定出的 QTL 一致。值得注意的是,基于甲基磺酸乙酯(EMS)诱导的突变系和大豆变异数据库(SoyGVD),筛选出 12 个潜在的候选基因,并对其在大豆油脂和蛋白质方面的功能进行了初步验证。这些研究结果为进一步研究大豆育种中的候选基因和标记辅助选择(MAS),以提高种子蛋白质和油脂含量奠定了基础。
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