
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
大规模研究惊讶的发现UQCRC1 蛋白截短变异与帕金森病密切相关
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月12日 来源:npj Parkinson's Disease 6.7
编辑推荐:
帕金森病(PD)与 UQCRC1 的关联存在争议。研究人员利用英国生物银行数据,探究 UQCRC1 非同义变异与 PD 风险的关系。结果发现 UQCRC1 蛋白截短变异(PTVs)与 PD 风险显著相关,为 PD 研究提供新方向。
在帕金森病(Parkinson's disease,PD)的研究领域,UQCRC1 基因与 PD 之间的关系一直迷雾重重。过往不同队列研究给出的结论相互矛盾,让人困惑不已。一些研究声称发现了 UQCRC1 基因的某些罕见变异与早期发病的家族性 PD 存在联系,比如在台湾人群队列研究中,发现 UQCRC1 c.941 A > C(p.Tyr314Ser)等变异与 PD 相关 ,且后续实验验证这些变异会破坏线粒体呼吸链复合体 III 的功能,进而导致周围神经病变。然而,诸多后续研究却未能在中国大陆人群、欧洲人群中重复出这种关联。有的研究在大量样本中未发现 UQCRC1 与散发性 PD 存在关联,也未检测到功能缺失变异的携带者,仅发现少量错义变异携带者。
这些研究结果的不一致,使得 UQCRC1 与 PD 的关系变得扑朔迷离。一方面,样本量小成为关键阻碍,UQCRC1 变异本身较为罕见,在小样本中难以被准确识别;另一方面,以往研究大多基于 PD 患者队列,缺乏大规模、基于普通人群的队列研究证据。为了驱散这片迷雾,解开 UQCRC1 与 PD 关系的谜团,来自昌平实验室等机构的研究人员展开了深入探索。
研究人员借助英国生物银行(UK Biobank)这一大型前瞻性人群队列资源,对 434,328 名欧洲样本的全外显子测序数据进行分析。他们采用基因负担测试方法,运用 BOLT-LMM 和 SKAT 软件,针对 UQCRC1 基因中的罕见变异(次要等位基因频率 < 0.1%)进行检测,同时使用逻辑回归估算优势比(Odds Ratio,OR) 。
在研究结果方面,研究人员有了重要发现。首先,在 UQCRC1 基因中识别出 32 个高置信度(high confidence,HC)的蛋白截短变异(protein-truncating variants,PTVs) ,这些变异的携带者有 120 人。经过分析发现,HC PTVs 与 PD 风险存在显著关联,携带 HC PTVs 的人群中 PD 患病率为 5%,而非携带者中仅为 0.89%。在 PD 病例中,0.16% 的患者携带符合条件的 UQCRC1 HC PTV,而对照组仅为 0.03%。其次,研究人员对不同算法注释的错义变异进行分析,却未发现 UQCRC1 错义变异与 PD 之间存在显著关联。此外,研究还发现携带 UQCRC1 HC PTVs 的 PD 患者平均诊断年龄为 73 岁,且无早期发病的 PD 患者。
从机制角度来看,研究人员推测 UQCRC1 PTVs 可能通过多种机制引发帕金森病。单等位基因缺失导致的单倍体不足,会使功能性蛋白减少,无法满足线粒体呼吸链复合体 III 正常组装的需求,进而损害氧化磷酸化过程;截短变异保留的相互作用结构域会破坏野生型蛋白的掺入,通过显性负效应加剧活性氧(ROS)的产生;这些变化共同作用,破坏线粒体膜电位,损害 PINK1/Parkin 介导的线粒体自噬。变异位置不同,造成的表型严重程度也有所差异,N 端截短主要导致单倍体不足,C 端变异则产生更强的显性负效应。这些缺陷通过生物能量衰竭、氧化应激和神经炎症(通过线粒体 DNA 释放)等途径,推动神经退行性变,并与 α - 突触核蛋白病理相互作用。
不过,这项研究也存在一定的局限性。英国生物银行中报告的健康参与者可能存在偏差,这可能会低估 UQCRC1 的携带者频率。而且,由于 PD 携带者数量有限,目前缺乏与英国生物银行规模相当的队列来验证研究结果,未来需要在更多样化的人群中进行重复研究。此外,研究目前仅基于统计测试发现 UQCRC1 HC PTVs 与 PD 的强关联,其背后的机制还需要未来的实验进一步阐明。
总体而言,这项发表在《npj Parkinson's Disease》的研究意义重大。它首次基于大规模人群队列,系统地探索了 UQCRC1 在帕金森病中的作用,发现 UQCRC1 的罕见 PTVs 与 PD 高风险显著相关,为帕金森病的研究提供了新的方向和潜在的遗传标记。同时,也解释了以往研究难以重复 UQCRC1 与 PD 关联的原因,为后续研究奠定了基础。未来,还需要更多基于大规模前瞻性人群队列的遗传研究来验证这一发现,并通过功能实验深入解析 UQCRC1 在帕金森病发病机制中的具体作用。
研究人员在开展研究时,主要运用了以下关键技术方法:一是利用英国生物银行提供的全外显子测序(WES)数据,该数据包含 469,835 个人的信息,经过一系列质量控制步骤后用于后续分析;二是运用 Ensembl Variant Effect Predictor(VEP)等工具对变异进行注释;三是采用 BOLT-LMM 和 SKAT 软件进行基因负担测试,并通过逻辑回归估算优势比。
生物通微信公众号
知名企业招聘