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法国斗牛犬高级别少突胶质细胞瘤的差异基因表达分析:肿瘤及微环境基因表达的品种特异性差异
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月10日 来源:Companion Animal Health and Genetics
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本研究针对法国斗牛犬高级别少突胶质细胞瘤(HGO)对免疫治疗反应差的问题,通过RNA测序技术对比其与拳师犬、波士顿梗的肿瘤转录组差异。研究发现31个差异表达基因(DEGs)及15条富集通路(如E2F靶点、mTOR信号等),揭示了品种特异性分子特征与免疫治疗响应差异的潜在关联,为犬类神经肿瘤精准治疗及人类胶质瘤模型优化提供新依据。
研究背景与意义
高级别少突胶质细胞瘤(HGO)是犬类最常见的原发性脑肿瘤,法国斗牛犬、拳师犬和波士顿梗作为同系品种虽共享高发病率,但法国斗牛犬接受免疫治疗后生存期(132天)显著短于其他品种(221天)。这一临床差异暗示肿瘤生物学可能存在品种特异性,但此前研究未系统探索基因表达层面的差异。明尼苏达大学的研究团队在《Companion Animal Health and Genetics》发表论文,首次通过转录组学揭示法国斗牛犬HGO的独特分子特征,为优化免疫治疗策略提供科学依据。
关键技术方法
研究团队对18例犬HGO样本(11例法国斗牛犬,7例对照品种)进行RNA测序(RNASeq),采用DESeq2分析差异基因,通过基因集富集分析(GSEA)鉴定关键通路。所有样本来自福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织,经质量控制(RIN>2)和标准化处理,测序深度达40M reads/样本。
研究结果
差异基因表达特征
法国斗牛犬HGO中鉴定出31个蛋白编码差异基因(DEGs),其中14个上调(如FGF4、DLA88、HSP90AB1),17个下调(如PNKP、BRAT1)。FGF4表达量最高(log2FC=6.44),可能与法国斗牛犬特有的FGF4逆转录基因相关;MHC I类分子DLA88的上调提示免疫逃逸机制激活。
通路富集分析
15条富集通路可归为三类:
讨论与意义
该研究首次证实犬HGO存在品种特异性转录组特征。法国斗牛犬中FGF4和DLA88的异常表达可能源于遗传背景,而免疫相关通路(如Allograft rejection)的富集与其临床预后差直接相关。这些发现不仅为犬类精准医疗提供靶点(如抑制HSP90AB1或mTOR通路),还提示人类胶质瘤研究中需考虑遗传背景对治疗响应的影响。未来需扩大样本验证DLA88等位基因的品种分布,并探索FGF4在肿瘤发生中的直接作用。
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