编辑推荐：
为探究嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PPGLs）中 11p15.5 区域遗传变化，研究人员分析 150 例肿瘤样本。发现 40% 病例该区域有变化，pUPD 为第二常见变化，且 11p15.5 区域变化在不同基因簇频率不同，为 PPGLs 发病机制研究提供新依据。
在医学研究的神秘领域中，嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PPGLs）就像隐藏在暗处的 “神秘敌人”，一直困扰着科研人员和临床医生。PPGLs 是源于胚胎神经嵴细胞的神经内分泌肿瘤，每百万人中约有 2 - 8 人患病，而且 30 - 40% 的患者存在已知易感基因的种系致病性变异。它的发生与 20 多个基因的突变相关，这些基因被分为假缺氧簇、激酶信号簇和 Wnt 信号簇。
此前研究发现，假缺氧簇与 DNA 甲基化变化有关，尤其是 11p15.5 区域的改变，并且该区域变化在假缺氧簇相关肿瘤中较为常见，像部分研究指出在特定基因相关的 PPGLs 中存在 11 号染色体整体或 11p15.5 区域的缺失。11p15.5 区域包含众多印记基因，如 H19 印记母源表达转录本（H19）、胰岛素样生长因子 2（IGF2）、钾电压门控通道亚家族 Q 成员 1（KCNQ1）、KCNQ1 反义转录本 1（KCNQ1OT1）和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂 1C（CDKN1C） ，这些基因在细胞生长、分化等过程中发挥着关键作用，其异常与多种癌症相关。此外，11p15.5 区域还与贝克威思 - 威德曼综合征（BWS）相关，不过罕见情况下 PPGLs 才会在 BWS 患者中出现。
尽管之前对 11p15.5 区域与 PPGLs 的关系有了一定认识，但仍存在诸多疑问。比如，除了已知的母源等位基因缺失，11p15.5 区域还有哪些变化？这些变化在不同基因簇的 PPGLs 中频率如何？是否能将 11p15.5 区域的变化作为某一基因簇的标记？为了解开这些谜团，来自国外的研究人员开展了深入研究，相关成果发表在《Endocrine - Related Cancer》上。
研究人员从 Motol 大学医院和布拉格综合大学医院招募了 150 例确诊为 PPGLs 的患者（85 名女性和 65 名男性，平均年龄 48.6 岁） ，获取了他们的冷冻组织样本。研究用到了以下几种主要关键技术方法：一是通过下一代测序（NGS）面板来识别种系和体细胞致病性基因变异；二是运用 SALSA MS - MLPA Probemix ME030 BWS/RSS 检测方法，检测 11p15 BWS/RSS 区域内 IC2（KvDMR）和 IC1（H19DMR）结构域中一个或多个序列的异常甲基化，以及该区域的缺失 / 重复情况；三是采用 SNP 微阵列研究，使用 Illumina 的相关芯片进行检测，并通过特定软件分析数据。
研究结果
- 11p15.5 区域变化的总体情况：对 150 个样本进行 MS - MLPA 和 SNP 阵列分析后发现，90 例（60%）样本的 11p15.5 区域无变化。最常见的变化是 11p15.5 区域母源等位基因缺失，有 45 例（30%） ；其次是父源单亲二体（pUPD），有 5 例（3.33%） ，其特点是检测区域无缺失，但不同甲基化区域有改变，如 H19 基因高甲基化、KCNQ1OT1 基因低甲基化；第三是父源等位基因获得，有 4 例（2.67%）。此外，还发现了其他几种较少见的变化。
- 不同性别、肿瘤类型及基因变异状态下的变化差异：统计分析显示，11p15.5 区域遗传变化的频率在男性和女性之间（P 值 = 0.7402）、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤之间（P 值 = 1）均无统计学差异。在有和无种系或体细胞致病性改变的样本之间，11p15.5 区域遗传变化频率也无统计学差异（P 值 = 0.868） 。不过，在母源等位基因缺失的样本中，种系或体细胞致病性改变的频率更高。
- 不同基因簇中 11p15.5 区域变化的差异：假缺氧簇 1 中有 14/18（77.77%）的样本在 11p15.5 区域存在改变，激酶信号簇 2 中则有 17/64（26.56%）的样本有改变，两者差异具有统计学意义（P 值 = 0.000008558）。簇 2 中观察到的变化更具异质性，与未发现种系或体细胞致病性变异的 PPGLs 组类似。这表明 11p15.5 区域在簇 2 的 PPGLs 发展中可能也有作用，但程度小于簇 1。
研究结论和讨论
这项研究意义重大。一方面，研究人员首次发现了体细胞 pUPD 在 PPGLs 中的存在，且它是第二常见的变化，这为 PPGLs 的发病机制研究提供了新的视角。另一方面，研究表明 PPGLs 的发展不仅与 CDKN1C 表达降低有关，还与 IGF2 表达增加有关，进一步揭示了 PPGLs 发病的复杂机制。
从基因簇的角度来看，虽然 11p15.5 区域变化在簇 1 中的频率高于簇 2，但簇 2 中也存在该区域的变化，这说明之前认为 11p15.5 区域变化仅存在于簇 1 的假设是错误的，不能将 11p15.5 区域变化作为簇 1 的标记。
研究过程中还发现了 MS - MLPA 和 SNP 阵列两种检测技术存在差异。部分样本中，SNP 阵列检测到缺失而 MS - MLPA 未检测到，这些样本多为多倍体，可能是多倍体影响了 MS - MLPA 的检测结果；还有部分样本 MS - MLPA 检测到变化而 SNP 阵列未检测到，推测是这些变化太小，超出了 SNP 阵列的检测范围。因此，研究人员建议如果条件允许，最好同时使用这两种技术；若只能选择一种，MS - MLPA 能检测更广泛的变化，包括 DNA 甲基化改变，是更好的选择。
总的来说，该研究为深入理解 PPGLs 的发病机制奠定了更坚实的基础，但 11p15.5 区域在 PPGLs 肿瘤发生中的具体作用仍需进一步研究确认。未来，随着研究的不断深入，有望基于这些发现开发出更精准的诊断和治疗方法，为 PPGLs 患者带来新的希望。
