TRMT10C 基因多态性与神经母细胞瘤风险的关联:中国儿童研究的新突破

【字体: 时间:2025年05月09日 来源:Human Genomics 3.8

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  为探究m1A修饰基因多态性与神经母细胞瘤(Neuroblastoma)易感性的关系,研究人员开展病例对照研究。结果发现 TRMT10C rs4618204 C>T 显著降低患病风险。该研究为早期诊断提供分子标记,意义重大。

  在儿童肿瘤的世界里,神经母细胞瘤是一种较为棘手的存在。它是起源于交感神经系统的实体肿瘤,在儿童中并不罕见,是儿科患者中第二常见的颅外实体肿瘤,在中国,每百万儿童中就有 7.7 - 8.8 例发病,在欧美发达地区,发病率差异更大 。而且,它的凶险程度不容小觑,约占肿瘤相关死亡率的 15%。低风险和中风险的神经母细胞瘤患者预后相对较好,5 年生存率能超 90%,但高风险患者即便接受了手术、化疗、放疗和免疫治疗等多种强化治疗,预后依旧很差。
更让人头疼的是,神经母细胞瘤具有高度异质性,临床和分子特征多种多样。像 MYCN 基因扩增在约 20 - 25% 的病例中出现,与患者预后不良相关;染色体 1p 和 11q 的缺失会增加患病风险;间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因突变、TERT 重排、ATRX 缺失以及 PTPN14、DOCK8 和 RAS 等基因突变,也都和神经母细胞瘤的发生、发展、复发紧密相连。虽然此前的研究已经发现了一些与神经母细胞瘤易感性相关的单核苷酸多态性(SNPs),但这些发现还远远不足以完全解释神经母细胞瘤的遗传机制。

与此同时,RNA 甲基化在肿瘤发生中的重要作用逐渐被揭示,其中N1 - 腺苷甲基化(m1A)是真核生物中普遍存在的一种 RNA 修饰。m1A修饰基因在多种癌症中都发挥着重要作用,可它们在神经母细胞瘤中的角色却还是个谜。在这样的背景下,为了进一步探索神经母细胞瘤的发病机制,找到更有效的早期诊断标记,广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心等机构的研究人员开展了一项关于m1A修饰基因多态性与神经母细胞瘤易感性关系的研究。该研究成果发表在《Human Genomics》上,为神经母细胞瘤的研究开辟了新的方向。

研究人员开展了一项病例对照研究,样本队列来源于南京医科大学附属儿童医院,共纳入 402 例神经母细胞瘤患儿作为病例组,473 例无肿瘤的儿童作为对照组。研究用到的关键技术方法主要有:一是通过 dbSNP 数据库筛选m1A修饰基因的 SNPs,利用 SNPinfo 和 LDlink 等在线工具预测功能和评估连锁不平衡;二是采用 TaqMan SNP 基因分型检测法对样本进行基因分型;三是运用多元逻辑回归分析评估基因多态性与患病风险的关联;四是借助基因型 - 组织表达(GTEx)数据库进行表达数量性状位点(eQTL)分析,探究 SNP 对基因表达的影响。

研究结果主要从以下几方面展开:

  1. m1A修饰基因多态性与神经母细胞瘤易感性的关联:对 23 个m1A修饰基因的候选多态性进行基因分型,经多因素调整后,发现 TRMT10C rs4618204 与神经母细胞瘤风险显著相关,携带 CT 和 TT 基因型的个体比 CC 基因型的个体患病易感性降低。
  2. 分层分析结果:进一步分层分析显示,TRMT10C rs4618204 CT/TT 基因型在年龄大于 18 个月、男性、肿瘤起源于腹膜后等亚组中,与降低的患病风险显著相关;TRMT10C rs3762735、TRMT6 rs451571 和 rs236110、ALKBH3 rs10768993 和 rs2292889 等基因的多态性,也在特定亚组中与患病风险存在关联。
  3. eQTL 分析结果:利用 GTEx 数据库进行 eQTL 分析,发现与 rs4618204 T 等位基因完全连锁不平衡的 SNP 基因型,与 TRMT10C 基因表达降低相关,如 rs6809742 T>C 和 rs13072301 C>G 变异,可使骨骼肌和胫动脉组织中 TRMT10C 基因表达下调。
  4. TRMT10C 基因与神经母细胞瘤风险和预后的关系:与正常肾上腺组织相比,神经母细胞瘤组织中 TRMT10C 基因表达显著升高,且在高风险和晚期神经母细胞瘤患者中表达更高。 Kaplan - Meier 分析表明,TRMT10C 基因高表达与患者不良预后相关。

研究结论和讨论部分指出,TRMT10C rs4618204 C>T 与降低神经母细胞瘤风险显著相关,可能是通过下调 TRMT10C 基因表达来实现的,是一个可信的神经母细胞瘤风险生物标志物。同时,TRMT10C 基因在神经母细胞瘤的发生、发展中可能起着重要作用,其可能通过与细胞分裂和 MYC 通路相互作用影响肿瘤发展,但具体分子机制还需进一步研究。此外,研究还发现其他一些基因多态性在特定亚组中与神经母细胞瘤风险有关,不过这些多态性在不同肿瘤中的作用存在差异。

这项研究首次在中国儿童中明确了m1A修饰基因多态性与神经母细胞瘤易感性的关联及潜在机制,为神经母细胞瘤的早期诊断提供了重要的分子标记,也为深入理解其发病机制提供了新的视角。但研究也存在一定局限性,如研究人群地域局限性、未考虑环境因素、多重检验可能导致假阳性结果等,后续还需要更多研究来进一步验证和完善相关结论。

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