单细胞染色体与批量转录组分析:鉴别局限性与转移性嗜铬细胞瘤及交感神经副神经节瘤的诊断新利器

【字体: 时间:2025年05月04日 来源:Oncogene 6.9

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  目前,约 10 - 20% 的嗜铬细胞瘤或交感神经副神经节瘤(PPGL)患者会发展为转移性疾病,但缺乏初诊时预测其生物学行为的精准生物标志物。研究人员开展相关研究,发现二者基因组景观相似但转录存在差异,这有助于初诊时患者分层。

  摘要:大约 10 - 20% 的嗜铬细胞瘤(pheochromocytoma)或交感神经副神经节瘤(sympathetic paraganglioma,PPGL)患者会发生转移性疾病,大多表现为异时性病变。遗憾的是,目前缺乏能够在初次诊断时预测 PPGL 生物学行为的精确生物标志物。研究人员对患有 PPGL 且被诊断为局限性或转移性疾病(包括同时性或异时性转移)的患者的肿瘤样本进行研究,通过应用单细胞全基因组测序(single-cell whole-genome sequencing)和批量转录组分析(bulk transcriptome analysis,包括对 RNA 序列的变异检测分析),开展了全面的分子分析。研究发现,PPGL 呈现出复杂的核型,存在反复出现的非整倍体现象,并且细胞间核型差异显著,这表明局限性和转移性肿瘤中都存在持续的染色体不稳定性(chromosomal instability,CIN)。另一方面,转录组分析揭示了局限性和转移性 PPGL 之间的一些差异,转移性 PPGL 中的 TNFα和 TGFβ信号通路在最初看似未发生转移、但后来发生异时性转移的 PPGL 原发性肿瘤样本中就已可检测到。总体而言,研究结果表明,虽然局限性和转移性 PPGL 一般具有相似的基因组景观,但它们在转移发生前的原发性肿瘤 PPGL 中就已表现出可检测到的转录差异。这一发现可能为改善初次诊断时的患者分层提供重要工具。
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