金纳米颗粒-Cas13d基因编辑系统:靶向RNA病毒的新型抗病毒策略

【字体: 时间:2025年05月03日 来源:Molecular Therapy Nucleic Acids 6.5

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  这篇研究突破性地开发了基于金纳米颗粒(Au_NPs)递送的Cas13d基因编辑系统,通过自发内吞途径靶向切割SARS-CoV-2和ZIKV的RNA基因组。实验证明Au_NPs-Cas13d复合物能高效共定位于早期内体(EEA1+),单次给药即可使SARS-CoV-2复制降低90%,其切割效率与脂质体转染的核糖核蛋白(RNP)相当(99.8%)。该研究为无转染需求的抗RNA病毒疗法提供了创新递送方案。

  

金纳米颗粒-Cas13d系统的构建与表征
研究团队选择直径12nm的球形金纳米颗粒(Au_12_PEG3000NTA_C)作为载体,通过镍离子螯合作用将带有His标签的Cas13d定向固定在纳米颗粒表面。动态光散射(DLS)分析显示,功能化后的Au_NPs粒径保持23.76±11.04nm,Zeta电位为-24.3±8.48mV,与裸纳米颗粒相比无显著差异。透射电镜证实Cas13d成功结合后,纳米颗粒仍保持单分散状态。

病毒靶向gRNA的设计筛选
针对SARS-CoV-2和寨卡病毒(ZIKV)的保守区域,研究人员设计了8种向导RNA(gRNA)。通过构建稳定表达Cas13b的Huh-7细胞系,发现靶向SARS-CoV-2依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)和核衣壳蛋白(N)的gRNA效果最佳,可使病毒拷贝数降低1个数量级;而靶向ZIKV非结构蛋白NS1的gRNA仅显示25%的抑制率。高内涵成像分析进一步验证,RdRP-gRNA能减少90%的SARS-CoV-2感染细胞。

纳米载体的细胞摄取机制
标记Alexa546的Au_NPs-Cas13d在15分钟内即可进入细胞,4小时达到峰值浓度。通过抑制剂阻断实验揭示其通过三条主要途径内化:50%依赖被动扩散,35%通过网格蛋白介导的内吞(CME),剩余部分通过快速内吞素介导的内吞(FEME)和巨/微胞饮作用。共聚焦显微镜显示21%的纳米颗粒与早期内体标志物EEA1共定位,显著高于脂质体转染组(7%)。活细胞追踪证实Au_NPs-Cas13d在胞质内可稳定存在12小时以上。

抗病毒效力的差异化表现
在SARS-CoV-2感染的Huh-7细胞中,单次给药Au_NPs-Cas13d使病毒释放量降低5倍,而传统RNP转染无显著效果。透射电镜观察到纳米颗粒与病毒颗粒在早期内体中的共定位现象。但对ZIKV的抑制效果截然不同:虽然入胞阶段可见共定位,但在病毒复制中心——高尔基体膜囊中几乎检测不到纳米颗粒,导致其抗ZIKV活性仅为脂质体RNP的1/4。多次给药可提升抑制效果,使ZIKV基因组减少2个数量级。

脱靶效应的精准控制
生物信息学预测187个潜在脱靶位点,但转录组分析仅发现9个基因表达下调。这种高特异性源于Cas13d的定向固定方式以及纳米颗粒的内体区室化分布,有效减少了与胞质mRNA的非特异性接触。体外切割实验证实,在病毒RNA:RNP比例为1:60时,Au_NPs-Cas13d与游离Cas13d的切割效率均达99.8%。

转化医学前景与挑战
该研究首次实现CRISPR-Cas13d的无转染递送,其气溶胶化特性为呼吸道病毒防治提供新思路。但Cas13d的多靶点处理能力有限,且对ZIKV等依赖特殊复制区室的病毒效果欠佳。未来需优化Cas蛋白的持续活性,并解决肺部给药可能遇到的黏液屏障问题。研究者计划在hACE2转基因小鼠中验证雾化制剂的抗SARS-CoV-2效果,这将为应对新发RNA病毒疫情储备关键技术。

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