编辑推荐:
帕金森病(PD)的遗传机制复杂,GBA1 变异与 PD 风险相关,但并非所有低葡萄糖脑苷脂酶(GCase)活性者都携带 GBA1 突变。研究人员开展全基因组关联研究,发现 GAA 位点新关联及多个 PD 风险位点与 GCase 活性有关,为深入理解 PD 机制提供新视角。
帕金森病(Parkinson’s disease,PD)是一种令人头疼的复杂神经退行性疾病。患者大脑中 α- 突触核蛋白(alpha synuclein)会在路易小体中异常堆积,同时黑质中的多巴胺能神经元也会逐渐减少,导致患者出现运动障碍、认知障碍等一系列症状,严重影响生活质量。目前,虽然知道遗传因素在帕金森病的发生发展中起着重要作用,但具体的发病机制仍像一团迷雾,尚未完全明确。
其中,GBA1 基因备受关注,它编码的葡萄糖脑苷脂酶(glucocerebrosidase,GCase)是一种溶酶体水解酶。当 GBA1 基因出现变异,会使 GCase 活性降低,这不仅是帕金森病常见的遗传风险因素,还会加快患者运动和非运动症状的发展进程。奇怪的是,并非所有 GCase 活性低的人都携带 GBA1 突变,这就意味着,还有其他未知的因素在背后 “捣鬼”,影响着 GCase 的活性。
为了揭开这些神秘因素的面纱,来自麦吉尔大学(The Neuro (Montréal Neurological Institute - Hospital), McGill University)等机构的研究人员踏上了探索之旅。他们开展了一项全基因组关联研究(genome - wide association study,GWAS),试图找出与 GCase 活性相关的遗传因素,以及验证之前报道过的相关关联。这项研究成果发表在《Molecular Neurobiology》上,为我们理解帕金森病的发病机制带来了新的曙光。
研究人员采用了多个关键技术方法。首先,收集了两个独立队列的样本,包括哥伦比亚大学(Columbia University)的 697 例 PD 患者和 347 例对照,以及帕金森进展标记倡议(Parkinson’s Progression Markers Initiative,PPMI)队列中的 357 例 PD 患者和 163 例对照。然后,运用液相色谱 - 串联质谱(liquid chromatography - tandem mass spectrometry,LC - MS/MS)技术测量酶活性,从干燥血斑或冷冻全血中检测 GCase、酸性 α - 葡萄糖苷酶(acid alpha - glucosidase,GAA)等多种酶的活性。在基因分析方面,使用特定的基因芯片进行基因分型,经过严格的质量控制和数据过滤后,进行基因插补和线性回归分析,最后通过固定效应荟萃分析整合两个队列的数据 。
GAA 和 GBA1 位点与 GCase 活性相关
研究人员对数据进行质量控制和插补后,对两个队列分别进行 GWAS 分析,再进行荟萃分析。结果发现,正如预期的那样,GBA1 位点与 GCase 活性关联最强,其中 N370S 变异的影响最为显著。在哥伦比亚队列中,N370S(rs76763715,β=-4.21,se=0.35,p=4.55×10-31)与 GCase 活性显著相关,在 PPMI 队列中同样如此(β=-5.05,se=0.76,p=1.25×10-10)。
令人惊喜的是,研究还发现了 GAA 位点与 GCase 活性的新关联。在哥伦比亚队列中,GAA 位点的相关变异(如 rs9899138,β=-0.96,se=0.17,p=7.55×10-9)表现出与 GCase 活性的显著关联 。通过进一步的分析发现,GAA 位点基因型似乎会影响 GCase 和酸性 α - 葡萄糖苷酶的相互作用。当调整分析模型,去除对酸性 α - 葡萄糖苷酶活性的调整时,GAA 位点与 GCase 活性的关联消失;而加入常见的 PD 相关 GBA1 变异(如 N370S、E326K 和 T369M)进行调整后,GBA1 和 GAA 位点的关联信号均下降。这些结果表明,GAA 位点与 GCase 活性之间存在复杂的关联,可能涉及到两种酶之间的相互作用 。
PD 相关变异与 GCase 活性相关
研究人员进一步探究已知的 PD 相关变异与 GCase 活性的关系。他们发现,除了 GBA1 位点的变异外,ANK2 位点的 rs13117519 变异在荟萃分析中也与 GCase 活性显著相关。在 PD 病例分层分析中,SNCA 位点的两个变异(rs356203,β=0.53,se=0.17,p=0.0015;rs356182,β=0.55,se=0.17,p=0.0017)在经过多重检验校正后,与 GCase 活性显著相关。此外,研究人员还对之前报道的与 GCase 活性相关的 TMEM175 和 LRRK2 位点进行验证,但并未发现显著关联,这可能与研究中的调整因素和去除 GCase 异常值有关 。
在这项研究中,研究人员发现了 GAA 位点与 GCase 活性之间的新关联,这可能反映了 GCase 和酸性 α - 葡萄糖苷酶之间的相互作用,暗示了溶酶体酶之间可能存在的稳态关系。同时,研究也进一步证实了多个 PD 相关基因(如 GALC、SNCA)与 GCase 活性的联系,并发现了 ANK2 基因与 GCase 活性的新潜在关联。这些发现对于我们深入理解 GCase 缺乏与整体溶酶体功能障碍的关系,以及 GCase 与其他溶酶体酶的相互作用机制具有重要意义。
不过,研究也存在一些局限性。比如统计效力不足,可能遗漏了一些影响较小的变异;无法评估一些罕见的 GBA1 致病突变;研究对象仅包含欧洲和德系犹太裔个体,存在人群局限性;酶活性测量方法可能无法准确反映真实的溶酶体环境;未充分考虑疾病亚型和严重程度等因素的影响。
尽管如此,该研究为帕金森病的研究开辟了新的方向。未来,研究人员可以在更大规模、更多样化的人群中重复这些研究,进一步验证这些发现,并深入探究相关基因和酶之间的作用机制,为帕金森病的诊断、治疗和预防提供更坚实的理论基础。