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缺血性脑卒中(IS)治疗手段有限。研究人员开展 IS 中糖基化相关基因(GRGs)的研究,经多方法筛选出 3 个关键 GRGs 并构建诊断模型,还发现 IS 患者免疫细胞浸润差异。该研究为 IS 诊疗提供潜在方向。
缺血性脑卒中(Ischemic Stroke,IS)是一种严重的神经系统疾病,治疗方法有限。近期研究发现,糖基化与 IS 的发生和预后密切相关,但 IS 中糖基化的转录组动态数据却十分匮乏。本研究旨在通过生物信息学全面探索 IS 中的糖基化相关基因(Glycosylation-Related Genes,GRGs),并评估其免疫特征。
研究过程中,通过加权基因共表达网络分析筛选出的基因、五条糖基化通路中的 GRGs 以及差异表达分析得到的差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)进行交叉分析,确定了 20 个候选 GRGs。随后,利用最小绝对收缩和选择算子(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator,LASSO)、随机森林(Random Forest)和支持向量机递归特征消除(Support Vector Machine - Recursive Feature Elimination,SVM-RFE)等方法,筛选出 3 个核心 GRGs(F5、PPP6C 和 UBE2J1)。此外,还构建并验证了与糖基化相关的基因诊断模型。研究结果显示,该诊断模型在训练集、验证集和合并数据集中,均能有效区分 IS 患者和健康个体,具有临床相关性。
研究人员通过无监督聚类分析,将 IS 患者分为三个亚群,发现不同亚群间免疫细胞浸润存在显著差异。总体而言,本研究成功鉴定出 IS 中的核心 GRGs,并探究了这些核心基因在免疫微环境中的作用,为 IS 的临床应用提供了潜在方向。