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在兽医领域，多病原体共感染对家禽健康影响重大却研究不足。研究人员针对鸡群中沙门氏菌感染问题，开展印第安纳沙门氏菌（S. Indiana）和肯塔基沙门氏菌（S. Kentucky）共感染研究。结果发现菌株多药耐药，共感染致死率高。这为防控家禽感染提供依据。
在禽畜养殖的广袤天地里，疾病就像隐藏在暗处的 “幽灵”，时刻威胁着家禽的健康。近年来，随着家禽养殖规模的不断扩大，各种病原体也开始 “蠢蠢欲动”。多病原体共感染现象逐渐增多，然而，人们对它在家禽领域的了解却十分有限。尤其是沙门氏菌，作为家禽感染的 “常客”，不同血清型的沙门氏菌给家禽健康带来了极大的挑战。印第安纳沙门氏菌（S. Indiana）和肯塔基沙门氏菌（S. Kentucky）在全球家禽养殖中广泛传播，但此前几乎没有关于它们共感染导致家禽死亡的报道，而且它们的耐药性问题也日益严重，这让家禽健康管理陷入了困境。为了解决这些棘手的问题，浙江大学生命科学学院动物科学学院、浙江大学海南研究院以及中国科学院大学杭州高等研究院浙江省系统健康科学重点实验室的研究人员展开了深入研究。
研究人员开展了一项针对成年鸡死亡病例的调查研究，旨在揭示印第安纳沙门氏菌和肯塔基沙门氏菌共感染的情况、特征以及影响。最终发现，这两种沙门氏菌共感染导致成年鸡快速死亡，且分离出的菌株表现出广泛的多药耐药性。同时，胚胎致死试验表明共感染菌株具有很强的致病性。该研究成果发表在《Animal Diseases》上，为家禽疾病防控和公共卫生安全提供了重要的参考依据。
在研究过程中，研究人员用到了多种关键技术方法。首先，通过细菌分离培养技术，从死亡鸡的肝脏、脾脏等多个器官中分离出沙门氏菌；接着，利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI - TOF MS）技术对分离菌株进行鉴定；采用肉汤微量稀释法进行抗菌药敏试验；借助全基因组测序及生物信息学分析技术，对菌株的耐药基因、毒力因子等进行检测分析；最后，开展鸡胚致死试验评估菌株致病性。
研究结果如下：
- 新共感染模式的出现：一只 32 周龄的泰和乌鸡因感染印第安纳沙门氏菌和肯塔基沙门氏菌在 24 小时内死亡，死亡速度远超单一沙门氏菌感染。死后解剖发现肝脾坏死且多器官有细菌，表明可能是协同毒力增强了血源性传播，这挑战了当前基于胃肠道症状的诊断模式。
- 基因组差异导致治疗难题：全基因组分析显示有三种不同菌株，两种血清型对八类抗菌药物均耐药，但耐药基因谱差异明显。如印第安纳沙门氏菌携带 14 个抗菌药物耐药基因（ARGs），肯塔基沙门氏菌携带 11 个，二者基因重叠率仅 38%。所有菌株都携带超广谱 β - 内酰胺酶基因（blaCTX - M - 65、blaCTX - M - 14b），对第三代头孢菌素交叉耐药。
- 移动遗传元件驱动耐药进化：研究发现，印第安纳沙门氏菌中检测到质粒复制子 IncHI2 和 IncHI2A，而肯塔基沙门氏菌中未检测到质粒，其 ARGs 可能由染色体编码。90.91% 的 ARGs 与移动遗传元件（MGEs）相关，且 ARGs 功能类别与 MGE 类型并非严格对应。
- 毒力协同超过基因组预测：胚胎致死试验表明，共感染菌株在 72 小时内导致 100% 的死亡率，超过了对照菌株。虽然两种血清型的毒力基因并不完整，但可能存在补偿机制，如印第安纳沙门氏菌的 cdtB 基因介导免疫抑制，或通过生物膜相关营养交换进行代谢交叉喂养。
研究结论和讨论部分指出，此次研究首次记录了印第安纳沙门氏菌和肯塔基沙门氏菌共感染导致家禽死亡的案例。这些菌株的多药耐药性由多种 ARGs 和 MGEs 介导，高致病性可能与关键毒力因子有关，尤其是印第安纳沙门氏菌的 cdtB 基因。这一研究结果强调了加强生物安全措施的紧迫性，如采用隔离饲养系统、定期监测、快速检测病原体、扑杀感染鸡群以及实施严格的抗菌药物管理计划（ASPs）等。这些措施不仅能应对共感染带来的直接威胁，还有助于全球 “同一健康” 倡议，对抗日益严重的抗菌药物耐药危机，对保障家禽健康和食品安全意义非凡。
