追踪疟原虫感染中的 CD4+ T 细胞克隆,揭示高保真记忆免疫应答机制

【字体: 时间:2025年04月27日 来源:Science Immunology 17.6

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  疟疾严重威胁人类健康,尤其对儿童危害极大。为探究人体 CD4+ T 细胞对疟原虫(Plasmodium falciparum,Pf)感染的免疫应答,研究人员对乌干达儿童和成人进行研究。结果发现 CD4+ T 细胞克隆具有 “克隆保真度”,TR1 细胞在抗疟免疫中起关键作用。这为疟疾防治提供新思路。

  疟疾,这个古老又顽固的健康杀手,长期以来严重威胁着人类的生命健康,尤其在疟疾高发地区,儿童深受其害。一直以来,科学家们都渴望揭开人体免疫系统对抗疟疾的神秘面纱,其中 CD4+ T 细胞在抗疟免疫中的作用备受关注。然而,此前对于人类 CD4+ T 细胞克隆在多次感染过程中的变化,以及它们的长期稳定性、可塑性和免疫记忆的保真度,科学界了解甚少。这主要是因为研究人类 T 细胞记忆面临诸多挑战,无论是进行受控的人体感染研究,还是在疟疾流行地区开展临床监测研究,都困难重重。现有的研究方法也存在缺陷,比如大多数研究无法同时获取 T 细胞克隆的表型信息和跟踪其随时间的变化。在这样的背景下,深入探究 CD4+ T 细胞对疟疾的免疫应答机制迫在眉睫。
为了攻克这些难题,来自国外的研究人员依托乌干达疟疾系统生物学和计算方法研究(MUSICAL)展开了一项极具意义的研究。该研究成果发表在《Science Immunology》上,为抗疟免疫研究带来了新的曙光。

研究人员运用了多种关键技术方法。他们从乌干达疟疾流行地区的儿童和成人中采集样本,这些样本来自东非国际卓越疟疾研究中心队列中的 MUSICAL 嵌套队列研究。然后,通过单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)和 T 细胞受体测序(TCRseq)技术,对样本中的 CD4+ T 细胞进行深入分析。

在研究结果方面:

  • 纵向 scRNA/TCRseq 助力研究体内 CD4+ T 细胞记忆:研究人员对乌干达儿童在疟疾感染前后不同时间点的 CD45RA?记忆 CD4+ T 细胞进行 scRNA/TCRseq。通过对大量高质量 CD4+ T 细胞的测序和分析,成功鉴定出 11 种转录上不同的记忆 CD4+ T 细胞群体,包括多种辅助性 T 细胞亚群、调节性 T 细胞亚群等,并明确了它们的相对丰度。
  • 七个 CD4+ T 细胞亚群展现克隆保真度:研究发现,几乎所有的克隆型都强烈倾向于七个 CD4+ T 细胞亚群中的一个,这种 “克隆保真度” 现象在不同个体中普遍存在。而且,克隆保真度与克隆扩增密切相关,随着克隆扩增,保真度显著提高。
  • 克隆追踪揭示亚群特异性激活程序:利用 TCR 序列追踪克隆,研究人员将不同的激活程序与静止状态联系起来。通过对比激活和静止状态下细胞的基因表达,发现了各亚群特异性的激活转录程序,还揭示了一些此前未知的生物学现象,如 TH2 细胞新的细胞因子表达特征等。
  • TR1 细胞主导Pf特异性 CD4+ T 细胞应答:研究表明,Pf特异性的 CD4+ T 细胞应答主要由 TR1 细胞主导。在乌干达儿童中,TR1 细胞在Pf特异性 CD4+ T 细胞中占比近 90%,而在疟疾 - naive 的北美成年人中则很少。同时,TR1 细胞的扩增与疟原虫血症相关。
  • TR1 细胞具有长期记忆和功能稳定性:通过追踪Pf特异性克隆型在多次感染中的动态变化,发现 TR1 细胞能够长期记忆,在感染后持续存在并在再次感染时克隆扩增。进一步研究发现,TR1 细胞存在转录异质性,包括激活态、效应态、记忆态和幼稚样态等不同亚群,且各亚群在疟疾感染过程中呈现不同的动态变化。

在研究结论和讨论部分,该研究首次证实记忆 CD4+ T 细胞存在克隆保真度,这一发现挑战了以往关于 CD4+ T 细胞可塑性的认知。同时,明确了 TR1 细胞在疟疾免疫中的重要地位,它们是一种真正的 CD4+ T 细胞亚群,具有长期记忆和稳定的功能。这不仅为理解 CD4+ T 细胞生物学提供了新视角,也为疟疾的治疗和预防开辟了新方向。然而,该研究也存在一定局限性,如仅在外周血中研究 CD4+ T 细胞应答,未涉及婴儿和更多成人的感染情况,也未明确循环 TFH细胞的情况。但总体而言,这项研究为后续在其他感染性疾病中研究 CD4+ T 细胞记忆奠定了基础,有望推动相关领域的进一步发展,为人类健康事业做出更大贡献。

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