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肠球菌（Enterococcus）的耐药性和致病性给医疗带来挑战。研究人员开展分离肠球菌特异性裂解噬菌体的研究，成功获得新型噬菌体 vB_EF_Enf3。它对粪肠球菌和屎肠球菌有广谱裂解活性，稳定性良好，为治疗肠球菌感染提供新方向。
在医疗领域，肠球菌这个 “小麻烦” 正引发大问题。它本是人体消化系统中的常住 “居民”，属于正常菌群的一部分。但近年来，它却变得越发 “嚣张”。肠球菌通过转座子和水平基因转移，获得了各种耐药基因，对许多抗生素产生了抗性，摇身一变成为医院感染的常见 “元凶”，是泌尿系统感染（UTIs）、心内膜炎、菌血症等疾病的重要致病菌。同时，它还能产生多种毒力因子，像肠球菌表面蛋白（ESP）、溶细胞素（CylA）、明胶酶（GelE）等，这些因子帮助肠球菌黏附在宿主组织上，形成生物膜，不仅能躲避人体免疫系统的攻击，还能耐受抗菌药物，让治疗变得困难重重。
面对肠球菌带来的这些难题，来自埃及艾因夏姆斯大学（Ain Shams University）等机构的研究人员决心寻找新的解决办法。他们将目光投向了噬菌体（bacteriophage），这种专门 “捕食” 细菌的微生物，具有特异性强、对人体无害等优点，有望成为对抗耐药肠球菌的有力武器。经过一系列研究，他们成功分离出一种新型裂解噬菌体 vB_EF_Enf3，这一成果发表在《AMB Express》上，为治疗肠球菌感染带来了新的希望。
研究人员采用了多种关键技术方法。首先，从医院污水中采集样本（因为污水中大概率存在肠球菌及其噬菌体），通过一系列筛选和鉴定步骤，分离出噬菌体。然后，运用透射电子显微镜（TEM）观察噬菌体的形态；利用牛津纳米孔测序技术对噬菌体进行全基因组测序和注释，分析其基因组成和功能。
研究结果如下：
- 肠球菌的分离与鉴定：研究人员从患者样本中收集了 102 株潜在的临床肠球菌分离株，最终鉴定出 65 株肠球菌。其中，粪肠球菌（E. faecalis）占 41.5%（n = 27），屎肠球菌（E. faecium）占 50.7%（n = 33），还有少量鹑鸡肠球菌（E. avium）和耐久肠球菌（E. durans）。
- 抗生素敏感性测试：这些肠球菌对多种抗生素表现出较高的耐药性，如氨苄西林 / 舒巴坦（96.9%）、红霉素（90.7%）、环丙沙星（87.6%）和多西环素（81.5%）。不过，利奈唑胺、替考拉宁、氯霉素和万古霉素的敏感性相对较高。此外，87.69%（n = 57）的测试分离株表现出多重耐药（MDR）表型，40%（n = 26）的分离株为耐万古霉素肠球菌（VRE）。
- 毒力标记物检测：在 65 株测试分离株中，25 株（38.5%）既能产生明胶酶又能形成生物膜。而且，生物膜形成能力与样本来源有关，尿液样本中分离出的肠球菌形成生物膜的比例最高。
- 噬菌体 vB_EF_Enf3 的特性：成功分离出 4 种噬菌体裂解物，其中 vB_EF_Enf3 表现出良好的裂解活性，初始滴度高达 1.5×109 PFU/mL。TEM 分析显示，它属于有尾噬菌体目（Caudovirales），头部直径约 100nm，尾部长度约 70nm。该噬菌体在 30 - 60°C 和 pH 3 - 8 的范围内能保持裂解活性，对 3 株屎肠球菌和 4 株粪肠球菌临床分离株具有裂解作用，展现出较广的宿主范围。全基因组测序表明，其基因组长度为 36,202bp，GC 含量为 34.4%，包含 36 个开放阅读框（ORFs），分类上属于病毒（Duplodnaviria; Heunggongvirae; Uroviricota; Caudoviricetes; Efquatrovirus）。
研究结论和讨论部分指出，肠球菌的耐药性和毒力给治疗带来了巨大挑战，而噬菌体疗法有望成为一种有效的替代治疗方法。新型噬菌体 vB_EF_Enf3 具有良好的热稳定性、pH 稳定性和较广的宿主范围，对粪肠球菌和屎肠球菌均有较强的裂解活性，是一种极具潜力的治疗候选药物，未来可进一步开展体内测试和药物制剂研究，为临床治疗肠球菌感染提供新的选择。这一研究成果为解决肠球菌感染问题提供了新的思路和方向，在耐药菌感染治疗领域具有重要的意义。
