癌症特异性转录本异构体的泛癌分析：揭示异构体转换对癌症中 RNA 结合蛋白与微小 RNA 相互作用改变的调控影响

研究人员开展了关于癌症特异性转录本异构体的研究，旨在探究转录本异构体转换在癌症发展中的作用。研究发现，癌症特异性显性表达转录本中，miRNA 和 RBP 的结合被破坏，且局部折叠能量（LFE）是关键因素，这对理解癌症发展机制意义重大。

　　同一基因主要表达的转录本异构体的转换已被确定为多种癌症进展的重要因素。这些转换会影响不同 3′非翻译区（3′UTR）的得失，而 3′UTR 是微小 RNA（miRNA）和 RNA 结合蛋白（RBP）结合的热点区域。在本研究中，发现在癌症特异性显性表达转录本中，miRNA 和 RBP 的结合受到干扰，这表明转录本转换可能在癌症进展和发展过程中对转录后基因表达的调控发挥作用。空间相关性分析表明，由转录本转换引发的 miRNA 和 RBP 结合的变化，可能会中断它们之间的相互作用。此外，统计分析显示，局部折叠能量（LFE）是因异构体转换而改变 miRNA 和 RBP 相互作用的关键因素。总体而言，该研究揭示了癌症特异性转录本的变化，可能由于异构体转换导致转录本局部 RNA 结构改变，进而影响 miRNA - RBP 相互作用，最终致使参与癌症发生和进展的关键基因失调。