探秘软珊瑚生物碱:开启骨质疏松治疗新 “钥”

【字体: 时间:2025年04月25日 来源:Scientific Reports 3.8

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  骨质疏松发病率攀升,严重影响健康。研究人员聚焦软珊瑚(Zoanthus sp.)生物碱,探究其对 DKK1 和 GSK-3β 的抑制作用。结果发现多种生物碱有潜力,为骨质疏松治疗提供新思路,有望开发创新疗法。

  在人口老龄化加剧的当下,骨质疏松已成为一个严峻的健康挑战。这种疾病就像一个 “隐形杀手”,悄无声息地侵蚀着人们的骨骼健康。它以骨密度降低、骨骼脆性增加为特征,使得患者骨折风险大幅上升,严重影响生活质量。目前,针对骨质疏松的治疗药物,如双膦酸盐类,虽然能在一定程度上抑制骨吸收或促进骨形成,但却伴随着胃肠道刺激、颌骨坏死等严重副作用,让患者在对抗疾病的同时,还要承受额外的痛苦。
在这样的背景下,台北医学大学的研究人员挺身而出,开展了一项极具意义的研究。他们将目光投向了海洋中的软珊瑚(Zoanthus sp.),这种海洋生物能产生多种结构独特的次生代谢产物,尤其是软珊瑚生物碱,此前研究发现其具有多种生物活性,或许在骨质疏松治疗方面有独特的潜力。研究人员旨在探究软珊瑚生物碱对 Dickkopf-1(DKK1)和糖原合酶激酶 - 3β(GSK-3β)的抑制作用,这两种关键蛋白是 Wnt 信号通路的重要调节因子,而 Wnt 信号通路与骨代谢紧密相关,其异常会导致骨质疏松。该研究成果发表在《Scientific Reports》上,为骨质疏松的治疗带来了新的希望。

研究人员运用了多种前沿技术来深入探索软珊瑚生物碱的奥秘。其中,分子对接技术就像是一把精准的 “钥匙匹配器”,它能预测软珊瑚生物碱与目标蛋白(DKK1 和 GSK-3β)之间的结合亲和力,帮助研究人员筛选出可能有效的化合物。分子动力学模拟则如同一个 “微观摄像机”,可以实时观察蛋白 - 配体复合物在动态过程中的稳定性和相互作用。密度泛函理论(DFT)计算就像一个 “电子显微镜”,能从电子层面揭示化合物的结构和反应性。

下面让我们详细看看研究的具体成果:

  • 分子对接:研究人员对 69 种软珊瑚生物碱进行分子对接研究。结果显示,对于 DKK1 蛋白,kuroshine F 的结合能最低(-8.952 kcal/mol),它能与多个关键残基相互作用,如与 CYS220、THR221 等形成氢键,与 ARG224 形成烷基键 。对于 GSK-3β 蛋白,kuroshine E 的结合能最低(-12.807 kcal/mol) ,它与关键残基形成多种相互作用,像与 LYS85 形成氢键,与 ILE62、LEU188 等形成其他键。这表明这些生物碱与目标蛋白有较强的结合能力,为后续研究奠定了基础。
  • 分子动力学模拟:通过 100 ns 的分子动力学模拟,研究人员进一步探究了蛋白 - 配体复合物的稳定性。对于 DKK1,除 zoanthamine 外,多数复合物的 RMSD 值稳定,表明结合稳定 。同时,一些关键残基如 VAL219、CYS200 等的 RMSF 值波动较小,说明这些残基在维持结构稳定中起重要作用。对于 GSK-3β,多数复合物也能较快达到平衡并保持稳定,且多数配体与关键残基形成稳定的氢键,如 TMU 与 TYR134、VAL135 等形成强氢键 ,这揭示了这些生物碱与目标蛋白在动态过程中的稳定结合模式。
  • 主成分和自由能景观分析:主成分分析(PCA)和自由能景观(FEL)分析从不同角度展示了蛋白 - 配体复合物的构象变化和稳定性。在 DKK1 复合物中,如 complexes D2 和 D8,在 PC1 - PC2 空间的构象更紧密聚集,FEL 分析显示其能量状态更稳定 。在 GSK-3β 复合物中,多数复合物构象聚集,表明结合稳定,但 complex G10 的构象分散,能量状态相对不稳定 。这些分析为理解复合物的稳定性和结合机制提供了重要信息。
  • MM-PBSA 分析计算结合自由能:利用 MM-PBSA 计算结合自由能,结果显示对于 DKK1,complex D2 的结合自由能最有利(-8.57 kcal/mol) ;对于 GSK-3β,complex G2 的结合自由能最有利(-26.42 kcal/mol) 。这表明这些复合物的结合更稳定,进一步证实了相关生物碱与目标蛋白的强结合能力。
  • 细胞活力和碱性磷酸酶(ALP)活性评估:研究人员选取了 3-hydroxynorzoanthamine、3-acetoxynorzoanthamine 和 norzoanthaminone 进行细胞实验。结果发现,3-hydroxynorzoanthamine 在不抑制 MG - 63 细胞增殖的情况下,能显著提高 ALP 活性,达到 197.15 ± 23.47% ,这初步表明其在促进成骨细胞功能方面有潜在作用。
  • 概念性 DFT 分析:DFT 分析显示,如 3α-hydroxyzoanthenamine、epioxyzoanthamine 等化合物具有明显的偶极 - 偶极相互作用。同时,3α-hydroxyzoanthenamine 的 HOMO - LUMO 能隙最小(3.90 eV) ,表明其生物活性和化学反应性较高,更易与生物大分子相互作用。

综合上述研究,研究人员得出结论:norzoanthamine、3α-hydroxyzoanthenamine、epioxyzoanthamine 和 7α-hydroxykuroshine E 等软珊瑚生物碱,在抑制 DKK1 和 GSK-3β 方面表现出巨大潜力,有望成为治疗骨质疏松的先导化合物。这些研究成果意义重大,不仅为骨质疏松的治疗提供了新的药物研发方向,而且拓展了人们对软珊瑚生物碱生物活性的认识。未来,还需要进一步开展体外和体内研究,对这些化合物的治疗潜力进行全面验证,同时可以对其结构进行优化,以提高治疗效果,为骨质疏松患者带来更多希望。

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