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新冠疫情期间,SARS-CoV-2 的快速检测至关重要。研究人员针对现有检测技术的不足,开展优化微流控芯片检测 SARS-CoV-2 的研究。利用田口法和 ANN-PSO,确定最佳参数,显著缩短检测时间。该研究为新冠检测提供新方案。
新冠疫情的爆发给全球公共卫生带来了巨大挑战,快速、准确地检测新冠病毒(SARS-CoV-2)成为了控制疫情的关键。传统的实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)虽然是检测 SARS-CoV-2 的主要方法,但它存在诸多缺点,比如需要昂贵的试剂、专门的设备以及专业的操作人员,检测过程也比较耗时。为了克服这些问题,各种即时检测(POC)生物传感器应运而生,然而,这些传感器在检测速度、灵敏度等方面仍有待提高。在此背景下,来自突尼斯多个研究机构的研究人员开展了一项重要研究,其成果发表在《Scientific Reports》上,为 SARS-CoV-2 的快速检测提供了新的思路和方法。
研究人员主要运用了田口法(Taguchi method)和粒子群优化(PSO)结合人工神经网络(ANN-PSO)的技术方法。田口法通过设计正交实验,系统地优化过程参数,减少实验次数,高效地确定关键参数对检测系统的影响。ANN-PSO 则利用人工神经网络进行预测建模,粒子群优化算法对网络参数进行微调,从而提高预测的准确性,以此来评估微流控芯片的性能。
研究结果
- 模型构建与验证:研究人员构建了微流控芯片的数学模型,涵盖了流体流动(基于 Navier-Stokes 方程)、抗原传输(Fick’s 第二定律)以及抗原 - 抗体结合动力学(一阶 Langmuir-Hinshelwood 吸附模型)等方面。通过与已有实验数据对比,利用均方根误差(RMSE)和平均绝对百分比误差(MAPE)进行评估,结果显示模型预测准确,能有效模拟微流控芯片检测过程。
- 参数优化:选取雷诺数(Re)、达姆科勒数(Da)、施密特数(Sc)和反应表面位置(X)作为优化参数,运用田口法的L9(34)正交表进行实验。通过计算信噪比(S/N)和分析各参数对检测时间的影响,发现 Da 对缩短检测时间影响最大(贡献率达 91.1%),X 影响最小(仅 0.3%)。最终确定最佳参数组合为Re=4×10?2 ,Da=1000 ,Sc=105 ,X=1 。在此条件下,微流控芯片的检测时间显著缩短至 21 分钟,且检测限(LOD)为 2.197 pmol/L ,定量限(LOQ)为 6.659 pmol/L 。
- 模型预测能力评估:分别使用多层感知器人工神经网络(ANN-MLP)和 ANN-PSO 对微流控芯片的检测时间进行预测。结果表明,ANN-PSO 模型性能更优,其调整后的决定系数RAdj2达到 0.98 ,均方根误差(RMSE)为 33.2 ,相比 ANN-MLP 模型,能更准确地捕捉和预测复杂模式。
研究结论与讨论
该研究成功优化了用于 SARS-CoV-2 快速检测的微流控芯片,通过田口法和 ANN-PSO 技术确定了最佳参数组合,大幅缩短了检测时间,提高了检测效率。ANN-PSO 模型在预测微流控芯片性能方面表现卓越,优于传统的 ANN-MLP 模型。这一研究成果不仅为 SARS-CoV-2 的快速检测提供了有效的解决方案,也为其他生物检测领域中微流控芯片的优化提供了借鉴,推动了生物传感器技术在疾病检测方面的发展,对全球公共卫生防控具有重要意义。