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下呼吸道感染常由细菌引起,快速精准识别病原体对治疗至关重要。研究人员对比蛋白酶 K(PK)和二硫苏糖醇(DTT)预处理支气管肺泡灌洗液(BALF)和痰液样本后,用多重 PCR(M-PCR)检测病原体的效果。结果显示 DTT 在痰液检测中更优,有助于提升检测准确性。
在呼吸健康的战场上,下呼吸道感染是不容忽视的 “劲敌”。它常常由细菌 “打头阵”,引发一系列棘手问题。想象一下,患者因下呼吸道感染而痛苦不堪,医生却不能快速准确地揪出病原体,治疗就如同在黑暗中摸索,不仅会延长患者住院时间,还可能让病情恶化,增加死亡风险。传统的检测方法耗时久,而新一代测序(NGS)成本高、周转时间长。多重 PCR(M-PCR)虽能同时检测多种病原体,但呼吸道样本中的黏液和细胞杂质却像 “捣乱分子”,干扰核酸检测,导致结果不准确。
为了攻克这些难题,山西医科大学附属运城中心医院的研究人员挺身而出,开启了一场意义非凡的研究之旅。他们的研究成果发表在《BMC Microbiology》上,为呼吸道感染检测带来了新曙光。
研究人员采用了多种关键技术方法。首先是样本处理技术,收集 30 份 BALF 样本和 20 份痰液样本后,将临床分离的肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)、流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)和铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)按特定浓度添加到样本中 。接着,分别用 PK 和 DTT 对样本进行预处理。之后,利用磁珠法和自动核酸提取系统提取核酸,并借助 Nano - 400 超微量核酸分析仪测定核酸浓度和纯度。最后,通过 M-PCR 检测病原体,记录 Ct 值(Ct 值与核酸浓度呈负相关) 。
下面来看看具体的研究结果:
- 显微镜观察:革兰氏染色结果显示,在未处理的 BALF 样本中,细菌结构完整、形态正常。PK 处理后的 BALF 样本中,细菌数量明显减少,背景物质也有所降低。而 DTT 处理后的 BALF 样本,几乎看不到完整细菌,背景物质近乎完全清除。在痰液样本方面,PK 处理后仍有大量完整的革兰氏阴性和阳性菌,DTT 处理后的痰液样本细菌数量和背景物质均显著减少。这表明 DTT 在破坏细菌结构和减少背景物质方面表现更出色。
- 核酸纯度和浓度比较:不同处理方法对 BALF 样本的核酸浓度和 A260/A280 比值影响不显著。痰液样本经 PK 和 DTT 处理后,核酸浓度显著高于未处理的 BALF 样本,但两种处理方法间无显著差异,A260/A280 比值在各处理组间也无明显差异 。这说明在核酸提取的纯度和浓度方面,PK 和 DTT 在 BALF 样本处理上效果相似,而痰液样本因其自身特性,核酸浓度受多种因素影响。
- M-PCR 结果比较:对于 BALF 样本,PK 和 DTT 处理后,四种细菌的 Ct 值均无显著差异,且检测率均为 100%。对于痰液样本,PK 处理后,四种细菌的 Ct 值与 BALF 样本差异显著;DTT 处理后,仅肺炎克雷伯菌和流感嗜血杆菌的 Ct 值与 BALF 样本有显著差异。在检测率上,痰液样本经 PK 处理后检测率为 87.5%,DTT 处理后则高达 100%,DTT 处理组显著高于 PK 处理组。这充分显示出 DTT 能更有效地从痰液样本中释放核酸,提高检测灵敏度。
综合研究结论和讨论部分,我们可以发现:对于 BALF 样本,PK 和 DTT 预处理对实验结果影响均不显著,必要时二者均可作为预处理方法。但对于痰液样本,DTT 在破坏细菌结构、减少背景干扰方面明显优于 PK,极大地提高了 PCR 准确性和病原体检测率。这一研究成果为临床实验室优化呼吸道样本预处理流程提供了重要依据,有助于提高呼吸道感染病原体的检测效率和准确性,让医生能更快更准地制定治疗方案,拯救更多患者于病痛之中。它也为后续研究指明了方向,未来研究可进一步探索不同样本和病原体的最佳预处理方法,以及 PK 浓度对实验结果的影响,不断完善呼吸道感染检测技术,为人类健康保驾护航。