肺泡灌洗液宏基因组下一代测序对 ICU 免疫低下重症社区获得性肺炎患者的关键价值

【字体: 时间:2025年04月24日 来源:Infection 5.4

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  免疫低下患者因重症社区获得性肺炎(SCAP)入住 ICU 风险高,早期精准治疗至关重要。研究人员开展多中心回顾性研究,对比常规微生物检测(CMTs)和肺泡灌洗液宏基因组下一代测序(mNGS)。结果显示 mNGS 优势显著,对诊疗及预后意义重大。

  在医疗科技不断进步的当下,免疫低下患者群体日益庞大,他们如同脆弱的 “易感人群”,在面对疾病时不堪一击。其中,重症社区获得性肺炎(SCAP)更是成为他们入住重症监护病房(ICU)的重要原因之一,如同隐藏在暗处的 “杀手”,严重威胁着这一群体的生命健康。据了解,SCAP 引发的急性呼吸衰竭,就像一座难以翻越的大山,让患者的康复之路充满艰辛。在治疗这类患者时,早期精准找到病原体并给予针对性的抗生素治疗,是改善预后的 “关键钥匙”。然而,传统的常规微生物检测(CMTs)却存在诸多弊端,检测耗时长,就像缓慢的蜗牛,难以满足临床快速诊断的需求;在检测非典型感染方面也不尽如人意,容易 “漏网之鱼”。正因如此,探寻更高效准确的检测方法迫在眉睫。
为了攻克这一难题,来自浙江中医药大学、复旦大学上海医学院等多家国内机构的研究人员联合开展了一项多中心回顾性研究。他们对 2021 年 5 月至 2024 年 10 月期间入住 ICU 且被诊断为 SCAP 的患者进行了深入研究。最终发现,肺泡灌洗液宏基因组下一代测序(mNGS)在病原体检测方面表现出色,对免疫低下的 SCAP 患者的诊断、治疗及预后都有着积极且重要的影响。该研究成果发表在《Infection》杂志上。

在研究方法上,研究人员从多个医院收集了 642 例疑似 SCAP 患者的病例,经过筛选最终纳入 610 例患者。这些患者被分为免疫低下组和免疫正常组。研究人员采集了患者的支气管肺泡灌洗液(BALF)、血液和痰液样本。对 BALF 样本进行 mNGS 检测,同时对各类样本进行 CMTs 检测。mNGS 检测包括样本的 DNA/RNA 提取、文库构建、测序以及生物信息分析等一系列专业操作,以此来确定样本中的病原体 。

下面来看看具体的研究结果:

  • 患者临床特征:对比免疫低下组和免疫正常组患者,发现两组在年龄、性别、部分基础疾病上无显著差异。但免疫低下组的降钙素原(PCT)、C 反应蛋白(CRP)、D - 二聚体水平更高,血小板计数更低,疾病严重程度评分(APACHE - II、SOFA、CURB - 65)更高,使用机械通气(MV)和血管活性药物的比例也更高123
  • mNGS 与 CMTs 结果一致性评估:mNGS 的阳性率在免疫低下组(94.11%)、免疫正常组(91.13%)以及所有患者(92.13%)中均高于 CMTs。Kappa 一致性检验表明两种检测方法一致性较差。进一步分析发现,在部分患者中,mNGS 和 CMTs 会出现仅一种检测方法阳性的情况,且两种方法均阳性的患者中,完全匹配的比例较低,部分匹配和不匹配的情况较为常见456
  • 两组检测病原体微生物的差异:免疫低下组混合感染更为常见(58.82%),高于免疫正常组(44.58%)。mNGS 检测出的多种细菌、真菌和病毒的比例在两组中均高于 CMTs,且免疫低下组中部分病原体(如棒状杆菌属、结核分枝杆菌等)的检测率高于免疫正常组789
  • mNGS 结果对两组诊断的临床影响:mNGS 结果在两组中多表现为新诊断和早期诊断,免疫低下组新诊断比例更高(42.16%)。同时,mNGS 检测出的混合感染和细菌感染率更高,且检测不出病原体的比例更低1011
  • mNGS 结果对两组治疗的临床影响:基于 mNGS 结果调整治疗方案后,两组治疗有效率均较高,且免疫低下组更高(65.69%)。当 mNGS 指导治疗有效时,两组 28 天死亡率均显著降低121314

研究结论和讨论部分再次强调了 mNGS 的重要意义。随着免疫低下人群的增多,SCAP 带来的危害愈发严重。mNGS 在检测病原体方面优势明显,能帮助医生更早发现细菌、真菌和病毒感染,及时调整抗生素治疗方案。不过,该研究也存在一定局限性,如不同中心样本处理可能存在差异,mNGS 未检测多种样本类型,且其临床应用受多种因素限制 。但总体而言,mNGS 在免疫低下 SCAP 患者的诊疗中有着不可忽视的价值,为临床医生提供了更有力的诊断工具,有望改善患者的预后,让更多患者受益。未来,还需要更多大样本、标准化的研究来进一步验证和完善 mNGS 在这一领域的应用。

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