不同发酵底物对瘤胃微生物及微生物源细胞外囊泡（EVs）的影响：探寻动物健康与生产的新契机

为探究不同发酵底物对瘤胃微生物群及其细胞外囊泡（EVs）的影响，研究人员以秸秆（纤维）、玉米淀粉（淀粉）和酪蛋白（蛋白）为底物进行体外发酵。结果发现不同底物显著影响瘤胃微生物多样性，不影响 EVs 形态和粒径，该研究为动物健康和生产提供重要参考。

　　日粮组成和微生物群在动物健康和生产性能中起着至关重要的作用。本研究旨在探索不同发酵底物对瘤胃微生物群及其细胞外囊泡（EVs）的影响。研究人员以秸秆（纤维）、玉米淀粉（淀粉）和酪蛋白（蛋白质）作为体外发酵的底物。发酵 24 小时后，收集样本并进行 16S rRNA 基因测序，以分析瘤胃微生物群。提取微生物源 EVs，并测定其形态和粒径。结果显示，纤维增加了瘤胃微生物的多样性，蛋白质增加了微生物的丰富度，而淀粉则降低了微生物的多样性和丰富度。蛋白质组的瘤胃微生物群以厚壁菌门（Firmicutes）为主，纤维组以拟杆菌门（Bacteroidota）为主，淀粉组则以普雷沃氏菌属（Prevotella）为主。主坐标分析（PCoA）表明，三组之间的微生物群落结构存在显著差异。在属水平上的线性判别分析效应量（LEfSe）分析确定，普雷沃氏菌属（Prevotella）、琥珀酸弧菌属（Succinivibrio）、梭菌属_UCG_014（Clostridia_UCG_014）在淀粉组中富集，而氨基酸球菌属（Acidaminococcus）、毛螺旋菌科（Muribaculaceae）、金字塔杆菌属（Pyramidobacter）在蛋白质组中富集。对于纤维组，富集的属包括 F082 和理研菌科_RC9_肠道群（Rikenellaceae_RC9_gut_group）。通过未观察状态重建对群落进行系统发育调查（PICRUSt2）分析表明，前十大微生物功能主要涉及信号和细胞过程（K06142、K03310、K02030、K06147、K01990、K02004、K01992、K02014）以及遗传信息处理（K06180、K03088），在这些过程中，纤维组的表现优于其他两组。此外，细胞外囊泡的粒径范围为 20 至 400 纳米，每组的平均粒径分布系数（PDI）接近 0.3，表明粒径均匀。总体而言，不同的发酵底物显著影响瘤胃微生物的多样性，但不影响微生物 EVs 的形态和粒径。