探秘西班牙人群面部形态与 SNP 关联:解锁面部遗传学新密码

【字体: 时间:2025年04月23日 来源:Scientific Reports 3.8

编辑推荐:

  在法医学等领域,准确预测面部外观意义重大,但面部形态受多种因素影响,研究存在挑战。研究人员针对西班牙人群,开展 116 个候选单核苷酸多态性(SNP)与面部表型关联的研究。发现 10 个 SNP 有显著关联,为面部遗传学研究及法医学 DNA 表型分析(FDP)提供重要依据。

  在人类的众多特征中,面部形态独一无二,每个人的脸都有着细微却独特的差异。从法医学的角度看,准确预测面部外观,能够为案件侦破、失踪人员身份识别提供关键线索,帮助警方缩小侦查范围,提高办案效率。然而,面部形态这一复杂性状,受到众多遗传和环境因素的共同作用,就像一团难以解开的乱麻。尽管全基因组关联研究(GWAS)已经发现了一些与面部特征相关的单核苷酸多态性(SNP),但这些研究结果在不同人群中并不总是能够重复验证。而且,欧洲不同地区人群的面部外观存在差异,已有的针对欧洲人群的研究成果,难以直接套用到各个亚群。为了深入探究面部形态的遗传奥秘,来自西班牙多所高校和研究机构,以及美国印第安纳大学印第安纳波利斯分校的研究人员,对西班牙人群展开了研究,相关成果发表在《Scientific Reports》上。
研究人员采用了多种技术方法。在样本采集方面,他们从西班牙人群中收集了 412 名个体的样本,详细记录了参与者的性别、年龄、体重等信息,还采集了唾液样本,并使用 3D 扫描仪获取面部 3D 扫描数据。在基因分析环节,先是从唾液样本中提取 DNA 并进行定量,接着挑选出 116 个与面部形态相关的候选 SNP,利用 Fluidigm 技术和 SNaPshot minisequencing 技术进行基因分型。同时,运用 Arlequin 软件计算群体遗传参数,使用 Matlab 软件对 3D 面部图像进行处理和分析,并通过规范相关分析(CCA)研究 SNP 与面部表型的关联。

研究结果主要包括以下几方面:

  • 群体遗传参数:对 116 个候选 SNP 的研究发现,除了两个 SNP(rs11713363 和 rs6695444)外,其他 SNP 的等位基因频率分布与先前公布的伊比利亚数据没有显著差异。经过 Bonferroni 校正后,大多数 SNP 符合哈迪 - 温伯格平衡(HWE),但有 4 个 SNP(rs145365164、rs1863716、rs6129266 和 rs6695444)例外。此外,位于同一候选基因内的 SNP 之间存在显著的连锁不平衡(LD),表明它们可能共同遗传。
  • 关联分析:在对 63 个面部区域进行 CCA 分析后,发现 116 个 SNP 中有 101 个可能影响面部形态(PCCA<0.05)。不过,经过错误发现率(FDR)调整后,只有 10 个 SNP 仍然具有统计学意义(PFDR<0.05)。这 10 个 SNP 在面部不同区域呈现出不同的关联模式:
    • 上唇 + 人中(象限 I):rs702489 和 rs12786942 与该区域显著相关,且这两个 SNP 与该区域的关联此前未被报道。rs702489 的 G>A 突变,会使鼻翼下方和人中侧面区域向外突出,周围区域向内凹陷;rs12786942 的 A>T 突变,会导致上唇和人中内侧区域向内凹陷,外侧区域向外突出。
    • 鼻子(象限 II):rs227833 与鼻子区域显著相关,其 G>C 突变会使鼻根和鼻梁向外突出,鼻桥、鼻翼外侧和鼻下区域向内凹陷。
    • 下脸(象限 III):rs11768577 和 rs7167736 与下脸区域显著相关。rs11768577 的 T>G 突变,会使鼻部、唇部和下巴中央区域向外突出,下颌和脸颊外侧区域向内凹陷;rs7167736 的 T>G 突变,会使下唇及下方区域、下巴侧面区域向内凹陷,下巴和下巴中央部分向外突出。
    • 上脸(象限 IV):rs3936018、rs72691108、rs6535972、rs17275866 和 rs7738892 与上脸区域显著相关。例如,rs3936018 和 rs72691108 会使额头中央凹陷、侧面突出;rs6535972 会使额头中央和上眶周区域向外突出,额头侧面和下眶周区域向内凹陷;rs17275866 与上脸的关联是新发现的,其 G>C 突变会使额头区域除眉毛和额头上部特定区域外向内凹陷;rs7738892 会使眉毛区域向内凹陷,太阳穴上方区域向外突出 。


在讨论部分,研究人员指出,这 10 个 SNP 中有 7 个与之前其他研究中发现的面部区域关联相符,进一步证实了这些 SNP 在不同人群中的重要性。同时,还发现了 3 个新的面部区域关联,这表明在不同的亚群中,基因与面部形态的关联可能存在差异,强调了针对特定亚群进行研究的必要性。此外,研究还发现一些 SNP 存在共分离现象,这为研究 SNP 作为单倍型对人脸外观的影响开辟了新方向。不过,目前基于 DNA 预测面部外观仍面临挑战,例如面部相关 SNP 解释的面部变异比例较低,即使 10 个 SNP 联合起来也只能解释 0.705% 的变异 。但该研究明确了一些对预测面部形态特征有价值的遗传位点,为未来构建更精准的预测模型提供了重要参考。

总的来说,这项研究不仅验证了一些之前发现的与面部形态相关的遗传位点,还在西班牙人群中发现了新的关联,为面部遗传学研究提供了更深入的认识。这对于法医学 DNA 表型分析(FDP)的发展意义重大,有助于提高通过 DNA 预测面部外观的准确性,为实际的法医调查和失踪人员身份识别等工作提供更可靠的依据。未来,还需要更多跨学科的合作研究,不断优化研究方法,进一步探索面部形态的遗传机制,推动 FDP 领域的发展,使其更好地服务于社会。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号