巴西东北部阿拉戈斯州菜豆黄脉病毒（MacYVV）群体结构探秘：地理因素如何塑造病毒分化？

菜豆金色花叶病毒属（Begomovirus）严重影响全球重要农作物生产。巴西研究人员针对巴西东北部阿拉戈斯州非栽培菜豆属植物上的菜豆黄脉病毒（MacYVV）展开研究，发现其遗传变异性低且存在地理相关的亚群结构，这有助于理解病毒与宿主关系。

　　菜豆金色花叶病毒属（Begomovirus，隶属双生病毒科Geminiviridae）包含的植物病毒，会对全球多种具有重要经济价值的农作物产量产生负面影响。这类病毒能感染众多非栽培植物，这些植物可能成为农作物疫情的替代宿主或接种源。在本研究中，研究人员评估了与巴西东北部阿拉戈斯州（AL）非栽培菜豆属（Macroptilium）植物相关的菜豆黄脉病毒（MacYVV；Begomovirus macroptilivenae）的遗传变异性和群体结构。2019 年至 2020 年间，研究人员从阿拉戈斯州不同城市采集的有症状植物中获取了 29 条完整的 DNA-A 序列。序列两两比对结果显示，其遗传变异性较低，与先前已鉴定的 18 条序列相似度在 93.9%-100% 之间。为更深入了解阿拉戈斯州菜豆黄脉病毒的群体结构，研究人员分析了包含 47 条序列的完整 DNA-A 数据集。尽管判别分析主成分法（DAPC）和结构分析法（STRUCTURE）推测出的菜豆黄脉病毒亚群数量略有差异，但结果都与病毒分离株间的系统发育关系相符，研究观察到五个得到充分支持且与地理位置相关的亚群。菜豆黄脉病毒群体的低变异性，可能与检测到的重组事件较少有关，这也反映出病毒与宿主之间长期的关系，意味着病毒已高度适应宿主。