综述：通过同源性（Identity-by-descent，IBD）进行疟疾基因组监测的潜力与陷阱

这篇综述聚焦疟疾基因组监测。同源性（IBD）在了解疟原虫种群结构、评估抗疟干预效果等方面潜力巨大。但疟原虫独特的进化和生物学特性会影响 IBD 方法准确性。文中探讨其应用现状、局限及未来方向，为疟疾防控提供新思路。

　　

亮点

• 同源性（Identity-by-descent，IBD）在疟疾基因组监测中作用显著，可用于探究疟原虫种群动态、传播规律，评估抗疟干预措施的效果，为疟疾防控提供重要信息。
• 疟原虫独特的进化和生物学特征会导致基于 IBD 的方法出现偏差。不过，通过全面评估和改进现有方法，能在一定程度上降低这种影响。
• 在感染复数（multiplicity of infection）的背景下，不同工具对 IBD 的定义存在差异。因此，在统一概念模型下正确解读后续结果，并根据样本、基因型数据类型和分析需求选择合适工具至关重要。

摘要

在流行病学层面进行疟原虫基因分型，对疟疾基因组监测意义重大。它有助于了解疟疾传播动态，以及疟原虫种群结构如何随抗疟干预发生变化。基于 IBD 的方法在疟疾基因组监测多个方面展现出潜力。然而，由于疟原虫的进化动态和生物学特性与人类等生物差异显著，现有方法需要进一步验证，同时也需开发新技术应对这些挑战。这篇综述对当前 IBD 的应用情况进行了梳理，分析了基于 IBD 方法的局限性，并对未来提升疟疾基因组监测水平的方向进行了探索 。