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为解决抗生素耐药菌监测难题，以色列国家抗生素耐药与感染控制研究所研究人员开展 “利用国家傅里叶变换红外光谱（FTIR）库检测新序列类型和耐药机制” 的研究，发现两种新耐药菌株，表明建立 FTIR 库可早期检测耐药菌，意义重大。
在当今医疗领域，细菌耐药问题愈发严峻，就像一场没有硝烟却异常激烈的战争。抗生素曾是对抗细菌感染的 “神药”，可如今，随着细菌不断进化，耐药性逐渐增强，许多抗生素的效果大打折扣。像碳青霉烯耐药肠杆菌科（CRE）这类 “超级细菌” 全球蔓延，高风险抗生素耐药菌株不断涌现，严重威胁着人们的健康。传统的细菌分型方法，比如全基因组测序（WGS）虽精准，却耗时费力；基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）虽常用，但准确性和重复性欠佳。在这样的困境下，寻找一种更高效、准确的监测抗生素耐药菌的方法迫在眉睫。
以色列国家抗生素耐药与感染控制研究所（NIARIC）的研究人员勇挑重担，开展了一项意义非凡的研究。他们利用国家傅里叶变换红外光谱（FTIR）库，对临床分离的细菌进行分析，旨在监测碳青霉烯酶产生的肠杆菌科（CPE），并及时发现新的抗生素耐药克隆及序列类型（ST）。最终，他们取得了令人瞩目的成果，成功识别出两种此前在以色列未被发现的耐药菌株，即携带新型质粒的产 NDM-5 大肠杆菌 ST650 和产 NDM 的肺炎克雷伯菌 ST307，这一发现为防控抗生素耐药菌传播提供了关键信息。该研究成果发表在《Antimicrobial Resistance 》杂志上。
在研究过程中，研究人员主要运用了以下关键技术方法：一是构建国家 FTIR 光谱库，收集来自急性护理医院的定期采集菌株、多药耐药菌现患率调查菌株以及医院爆发感染时送检的菌株；二是进行 FTIR 分析，依据红外光被细菌细胞分子吸收情况生成光谱，构建树形图，筛选新聚类；三是开展全基因组测序（WGS），对 FTIR 识别出的新聚类进行深入研究，分析菌株的基因特征。
研究结果如下：
- 大肠杆菌 ST650 聚类的鉴定：FTIR 分析发现由 12 株碳青霉烯耐药大肠杆菌组成的新聚类。全基因组测序（WGS）显示，这些菌株均属于 ST650，携带 blaNDM基因，对多种抗生素耐药，且部分菌株对氨曲南 / 阿维巴坦耐药。基因组特征分析表明，菌株携带多种抗生素耐药基因（ARGs），由 IncFI-IncFII 复合质粒携带 blaNDM-5基因，该质粒在以色列属首次发现，与美国白尾鹿中分离出的质粒高度相似。
- 肺炎克雷伯菌 ST307 聚类的鉴定：通过国家 FTIR 光谱库常规审查，发现 12 株碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌组成的新聚类。WGS 显示，它们属于 ST307，携带 KL102 和 O2v2，多数菌株携带 blaNDM-1。这些菌株对多种抗生素耐药，基因内容和毒力因子存在差异。此外，还发现了携带 NDM-1 的 IncM1 型质粒 pNCICAN-DM-ST307-il。
研究结论表明，建立区域或国家 FTIR 库是早期检测新兴抗生素耐药克隆的有效工具。在讨论部分，研究人员指出，FTIR 在疫情检测和回顾性流行病学分析方面优势明显，但实验室间的重复性有待提高。此次研究发现的大肠杆菌 ST650 和肺炎克雷伯菌 ST307 耐药克隆，其传播和潜在风险不容忽视。新发现的质粒可能存在人与动物间的传播，而肺炎克雷伯菌 ST307 作为新兴高风险克隆，其携带的耐药质粒在以色列的出现值得警惕。这一研究成果为全球抗生素耐药菌监测和防控提供了重要参考，有助于制定更有效的防控策略，保障公众健康。
