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BRCA1/2 基因变异与遗传性癌症密切相关。为明确阿联酋迪拜癌症及高危家庭筛查队列中 gBRCA1/2 变异特征,研究人员对 443 例患者测序分析。结果发现多种变异类型,其研究为癌症个性化管理及后续大规模研究奠定基础。
癌症严重威胁着人类健康,在全球范围内,每年都有大量新发病例和死亡病例。在阿联酋,癌症同样是导致死亡的重要原因之一,其中乳腺癌在女性癌症中居首位,且发病年龄相对年轻。BRCA1 和 BRCA2 基因(BReast CAncer gene,乳腺癌基因)在 DNA 修复和维持基因组稳定性方面起着关键作用,其变异与多种癌症的发生密切相关,尤其是遗传性乳腺癌和卵巢癌(Hereditary breast and ovarian cancer,HBOC)。不仅如此,携带 BRCA 变异的个体患前列腺癌和胰腺癌的风险也会显著增加。不过,携带 BRCA 变异的癌症患者有机会接受像聚 ADP 核糖聚合酶(PARP)抑制剂和铂类化疗等靶向治疗,从而获得更好的治疗效果。
然而,BRCA1/2 基因变异的流行率在全球不同地区差异很大,这与种族、民族等因素有关。在阿拉伯国家,虽然近亲结婚率较高,理论上可能存在独特的 BRCA1/2 变异,但相关研究却非常有限,而且已有的研究在基因变异特征的描述上也不一致。在阿联酋,此前的研究大多集中在 BRCA1/2 变异的流行率上,对于其基因变异的遗传特征,以及在高危家庭筛查队列中的数据都十分匮乏。为了填补这些空白,来自迪拜遗传学中心、迪拜医院等机构的研究人员开展了一项关于阿联酋迪拜癌症及高危家庭筛查队列中 gBRCA1/2 变异特征的研究,该研究成果发表在《Journal of Cancer Research and Clinical Oncology》上。
研究人员开展此项研究时,主要运用了以下关键技术方法:首先,从 2017 年至 2022 年,收集了 443 例患者的样本,这些患者包括 306 例确诊患有乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌和胰腺癌的患者,以及 137 例因家族癌症病史被视为高危人群的健康家庭成员。接着,采集所有患者的外周血样本,提取基因组 DNA(gDNA) ,并对其进行质量控制和定量。然后,使用全基因测序技术对样本进行检测,之后利用变异解读和计算机预测工具对数据进行分析,依据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南,将所有 BRCA1/2 变异分为致病性 / 可能致病性(P/LP)或意义不明的变异(VUS) 。
研究结果如下:
- 基线人口统计学特征:在研究人群中,阿联酋人占 48%,非阿联酋人占 52%。癌症队列患者的中位年龄为 48 岁,其中乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌患者相对年轻,前列腺癌患者年龄较大。家族筛查队列的中位年龄为 41 岁,大多数为阿联酋女性。
- 癌症队列中的 gBRCA1 和 BRCA2 变异:在癌症队列中,38/306(12.4%)的样本携带 P/LP 或 VUS 变异。其中,23 例(7.5%)为 P/LP,15 例(4.9%)为 VUS。BRCA1 和 BRCA2 的 P/LP 变异在不同癌症类型和不同种族患者中分布不同。例如,在阿联酋乳腺癌患者中,BRCA1 的变异多为缺失移码变异;在非阿联酋患者中,BRCA1 的无义变异和移码变异较为常见。在 BRCA2 基因中,也观察到多种变异类型,不同种族患者的变异模式同样存在差异。对于 VUS,在 BRCA1 和 BRCA2 基因中均有发现,不同软件对其致病性预测结果不同,部分 VUS 可能对蛋白质功能有影响。
- 家族筛查队列中的 gBRCA1 和 BRCA2 变异:在家族筛查队列中,14/137(10%)的样本携带 BRCA1 和 BRCA2 的 P/LP 或 VUS 变异。其中,5 例(3.6%)为 P/LP,9 例(6.6%)为 VUS 。在 BRCA1 基因中,观察到致病性缺失变异和错义变异;在 BRCA2 基因中,也发现了致病性变异和常见的 VUS,部分变异经计算机预测对癌症易感性有重要意义。
- 体重指数(BMI)对癌症风险的影响:研究未发现 BMI 与 BRCA1/2 携带者癌症风险之间存在关联。
研究结论和讨论部分指出,该研究首次全面分析了阿联酋迪拜不同种族癌症及高危家庭筛查队列中 BRCA1/2 的 P/LP 变异和 VUS。研究发现,在癌症队列中,乳腺癌患者发病年龄较轻,且 TNBC 亚型的比例较高。BRCA2 变异的频率高于 BRCA1,不同癌症类型和 BC 亚型中 BRCA1/2 变异的分布存在差异。在家族筛查队列中,也观察到多种 BRCA1/2 变异。这些变异有的在之前的研究中已被报道,有的则是新发现的。研究中关于 VUS 的发现也为进一步研究其临床意义提供了线索。不过,目前不同酋长国之间 BRCA1/2 变异阳性率存在差异,可能与样本量、研究设计和检测方法等因素有关。因此,需要在阿联酋七个酋长国开展更大规模、更标准化的研究,以准确确定 gBRCA1/2 变异的流行率和分布,为制定统一的健康意识提升计划、筛查工具和管理方案提供依据,从而更好地对阿联酋居民进行癌症防治的个性化管理。