基于时空基扩展与多主体fMRI数据的联合分析-合成字典学习算法:同步捕捉神经活动的高变异与平滑动态

【字体: 时间:2025年04月21日 来源:Scientific Reports 3.8

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  针对多主体fMRI分析中模型过拟合与泛化能力的平衡难题,Muhammad Usman Khalid团队提出联合分析-合成字典学习(JASDL)算法。该研究通过融合时空先验信息与多主体时空成分,在保留跨主体差异性的同时实现模型复杂度正则化。实验表明,JASDL合成字典的相关系数和F-score均值较现有技术提升22%,为神经活动动态捕捉提供了新范式。

  

在神经科学研究领域,功能磁共振成像(fMRI)技术犹如一把双刃剑。虽然其高空间分辨率能揭示大脑认知处理的功能组织特征,包括神经网络分离(NNS)和神经网络整合(NNI),但数据分析方法始终面临严峻挑战。过去十年间,字典学习(DL)虽在盲源分离(BSS)框架中逐渐取代独立成分分析(ICA),却始终被模型拟合问题所困扰——传统损失函数对训练数据的过度拟合会淹没真实的神经信号,而多主体(MS)分析又必须保留个体间差异。这个"既要又要"的困境,正是脑科学研究亟待解决的"戈耳狄之结"。

来自沙特阿拉伯伊玛目穆罕默德·本·沙特伊斯兰大学和文莱达鲁萨兰大学的研究团队另辟蹊径,提出名为联合分析-合成字典学习(JASDL)的创新算法。该研究巧妙地将时空(ST)先验信息(PI)与MS-ST成分相结合,前者包含神经科学知识衍生的生物先验(如脑网络模板)和数学先验(如三维立方B样条),后者则通过稀疏ST盲源分离(ssBSS)方法估算。通过设计利用三因子和四因子分解矩阵逼近的分析/合成代价函数,JASDL能同时建模时间平滑度和空间假阳性抑制,同时保留MS变异。研究成果发表在《Scientific Reports》期刊,为复杂神经活动的动态捕捉提供了全新解决方案。

研究团队采用三项关键技术:首先构建包含模型化血流动力学响应函数(MHRs)和离散余弦变换(DCT)基的合成基础字典;其次整合功能脑网络(FBNs)和内在脑网络(IBNs)等生物先验与三维样条基等数学先验;最后通过阈值相关(THC)方法优化稀疏表示。实验数据包含Human Connectome Project的块设计fMRI数据集和Simtb工具箱生成的合成数据。

【Why joint analysis-synthesis dictionary】部分揭示,传统DL方法如K-SVD会同时学习噪声与潜在趋势,而仅使用预定义字典的基扩展DL(BEDL)虽能重建平滑时间过程(TCs),却无法部署预定义稀疏码增强空间恢复。JASDL通过分解主体数据为MS-ST成分和三因子,以及PI-ST成分、ST基函数和四因子,首次实现图1d所示的平滑TCs/空间图(SMs)与图1b过拟合趋势的同步生成。

【Proposed model】详细阐述了创新性的目标函数设计。公式(3)包含四个保真项:数据逼近项‖Ym-DqAmBmXqF2、稀疏码逼近项‖Xm-SmHqYmF2、字典逼近项‖Dm-YmZqTmF2,以及正则化项λ‖bmkXq1+λ‖Zqtm,k1。通过表1所示算法实现坐标下降优化,其中分析字典Hm=SmHq和合成字典Dm=DqAm的联合学习是关键突破。

【Mathematical and biological priors】展示了先验信息的精心设计。合成基础字典包含DCT基(数学先验)和MHRs(生物先验),稀疏码则整合FBNs/IBNs和三维样条基。特别值得注意的是,研究者通过Cox-de Boor递归公式生成样条基Sx,y,z=Sx?Sy?Sz,其分段特性为局部控制提供优势,如图3所示。

【Simulation study I】验证了单主体数据完全由1D DCT基和2D样条基建模的可能性。改进的swsDL方法(nswsDL)在空间噪声较高时仍保持优异性能,其空间源与真实源的相似度显著优于自适应一致序列字典(ACSD),如图4所示。这提示fMRI预处理中的空间平滑步骤可能被替代。

【Simulation study II】通过六主体合成数据集证明JASDL的优越性。在40次重复实验中,JASDL合成恢复(JASDLs)的空间/时间特征恢复始终领先,分析恢复(JASDLa)次之。图6显示即便空间重叠增加,JASDLs仍保持最高恢复率。组分析结果(图7a)进一步证实,JASDLs在F-score和相关系数上全面超越压缩在线DL(CODL)、ssBSS等方法。

【Block design dataset】研究将算法应用于真实fMRI数据。通过SPM-12工具箱预处理后,JASDLs在运动皮层任务激活检测中展现出卓越的敏感性和特异性。图12a显示JASDLs在所有源恢复案例(包括10个静息态网络)中均表现最佳,其恢复的TCs与MHRs的相关系数显著优于其他方法。

这项研究开创性地解决了神经影像学领域的核心矛盾:如何在保留个体差异的同时获得群体一致性特征。JASDL算法通过分析-合成字典的协同学习,既平均了个体噪声,又重建出群体水平的平滑动态。其创新性体现在三个方面:首次实现过度拟合趋势与最优趋势的同步建模;通过加权代价函数(α∈(0,1))灵活控制假设权重;将正则化分解为过度和适度两部分以增强激活图分离。实验证明,相比现有技术,JASDL合成字典的相关系数和F-score均值提升22%,为理解复杂神经活动提供了新工具。未来,该方法

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