CITK 通过 HDAC6 调控 DNA 双链断裂位点 BRCA1 招募:为 MCPH17 综合征治疗带来新曙光

【字体: 时间:2025年04月21日 来源:Cell Death & Disease 8.1

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  在大脑发育过程中,维持基因组完整性至关重要,而 CITK 基因缺陷会导致 DNA 损伤积累等问题,引发 MCPH17 综合征。研究人员开展了 CITK 在同源重组(HR)及微管动力学中作用的研究。结果发现 CITK 通过 HDAC6 调控 BRCA1 定位,且靶向 HDAC6 可改善相关表型。这为 MCPH17 综合征治疗提供新方向。

  大脑的正常发育离不开神经祖细胞的快速且持续增殖,在此过程中,维持基因组的完整性尤为关键。因为在神经祖细胞增殖和神经发生期间,与复制相关的 DNA 链断裂频繁发生。DNA 双链断裂(DSBs)的积累对神经祖细胞来说是极具毒性的,它可能引发染色体重排和突变,最终导致细胞死亡。
目前,修复 DSBs 主要通过同源重组(HR)和非同源末端连接(NHEJ)两种方式。其中,HR 在维持基因组保真度方面起着关键作用,它在细胞周期的 S 中期到 G2 期持续进行,相对缓慢但准确性高,以姐妹染色单体作为修复模板。然而,在大脑发育过程中,DNA 损伤修复机制一旦出现缺陷,就会引发严重的神经系统疾病,微头畸形(Microcephaly)便是其中之一。

原发性遗传性微头畸形(MCPH)大多由单基因隐性突变引起,至今已发现 30 个相关基因。Citron 激酶(CITK)基因就是其中之一,其突变会导致 MCPH17 综合征。CITK 缺失会使神经祖细胞出现微管不稳定、有丝分裂纺锤体定位缺陷、胞质分裂失败以及 DNA DSBs 积累等问题,最终引发依赖 TP53 的细胞衰老和凋亡。虽然已有研究表明 DNA 损伤积累与 HR 受损有关,但 CITK 在 HR 过程中的具体作用,以及微管动力学是否参与其中,仍有待进一步探索。

为了解开这些谜团,来自意大利都灵大学神经科学研究所(Neuroscience Institute Cavalieri Ottolenghi)、都灵大学 “Rita Levi Montalcini” 神经科学系等多个研究机构的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表在《Cell Death and Disease》上,为揭示 MCPH17 综合征的发病机制和潜在治疗策略提供了重要线索。

研究人员在开展研究时,运用了多种关键技术方法。在细胞实验方面,他们通过 RNA 干扰(RNAi)技术下调相关基因的表达,以此研究基因功能;利用免疫沉淀和蛋白质免疫印迹(Western Blotting)技术,分析蛋白质之间的相互作用和表达水平;采用免疫荧光技术,观察细胞内蛋白质的定位和分布。在动物实验方面,他们构建了小鼠和斑马鱼模型,通过基因编辑和药物处理等手段,研究相关基因和蛋白在体内的功能。

研究结果如下:

  1. CITK 敲低损害 BRCA1 在 DSBs 的招募:研究人员利用 ONS76 髓母细胞瘤细胞进行实验,通过 RNAi 下调 CITK 表达,并使用博来霉素(Bleomycin)诱导 DSBs 积累。结果发现,早在转染后 24 小时,与对照组相比,CITK 缺失的细胞中 53BP1 标记的核焦点(一种可靠的 DSBs 增加标记)显著积累,而 BRCA1 焦点数量却减少,BRCA1 信号与 53BP1 焦点的共定位强度也明显降低。48 小时后,这些效应更加显著,同时 BRCA1 和 RAD51 蛋白及转录本水平也显著下调。这表明 CITK 对于 DNA 损伤诱导后 BRCA1 在 DSBs 的有效招募至关重要。
  2. CITK 缺失而非其催化活性损害 BRCA1 水平:研究人员利用携带临床相关移码(FS)或 CIT 激酶失活(KI)变异的人类多能干细胞分化的神经组织进行研究。结果发现,在哺乳动物中,CIT 的非催化结构域而非催化活性,在神经祖细胞发育过程中对 BRCA1 水平的调节起着关键作用。
  3. CITK 与 HDAC6 相互作用并调节其核水平:研究人员发现,CITK 敲低的样本中,α - 微管蛋白赖氨酸 - 40 乙酰化(ac - TUB,微管稳定性的关键指标)水平显著降低。通过对 CITK 相互作用组的分析,他们发现去泛素化酶 CYLD 和 HDAC6 与 CITK 存在相互作用。进一步实验证实,CITK 与 HDAC6 存在共免疫沉淀现象,且 CITK 能够调节 HDAC6 的核定位,CITK 缺失会导致 HDAC6 核水平显著增加。
  4. 靶向 HDAC6 恢复 BRCA1 水平并对抗 CITK 缺失细胞中的 DNA 损伤:研究人员通过 RNAi 降低 HDAC6 水平,发现 CITK - HDAC6 双敲低样本中 BRCA1 丰度恢复到对照水平,53BP1 阳性焦点数量也恢复正常。使用 HDAC6 特异性抑制剂 Tubastatin A(TubA)处理 CITK 缺失的 ONS - 76 细胞,同样能够显著增加 BRCA1 核积累,恢复 53BP1 焦点数量。此外,微管稳定剂紫杉醇(Paclitaxel)处理也能降低 HDAC6 核水平,防止 CITK 缺失导致的 DNA 损伤增加。
  5. HDAC6 抑制恢复 cita 功能缺失斑马鱼胚胎的微头畸形:斑马鱼有两个 CIT 同源物,其中 cita 与小鼠和人类的 CIT 基因在转录和蛋白质水平上具有较高的序列保守性。研究人员通过注射反义吗啉代寡核苷酸或 CRISPR - Cas9 sgRNAs,构建了 cita 功能缺失的斑马鱼模型,该模型出现了明显的头部尺寸减小的微头畸形表型。而注射全长小鼠 CITK(mCITK)表达质粒能够显著恢复头部尺寸。此外,抑制 Hdac6(通过 TubA 处理或 hdac6 敲低)能够有效改善 cita 功能缺失斑马鱼胚胎的微头畸形表型。

综上所述,研究人员的实验表明,CITK 在 HR 中起着不可或缺的作用,它通过与 HDAC6 相互作用,调节 BRCA1 在 DSBs 位点的招募,进而影响 DNA 损伤修复。这一发现揭示了 HR 与微管动力学之间的功能联系,为深入理解 MCPH17 综合征的发病机制提供了新的视角。同时,靶向 HDAC6 能够有效改善 CITK 缺失导致的 DNA 损伤和微头畸形表型,这为 MCPH17 综合征的治疗提供了潜在的新策略,有望为相关疾病的临床治疗带来新的突破。

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