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为解决重度抑郁症(MDD)发病机制不明、诊断治疗困难的问题,研究人员开展了 MDD 相关信号通路、免疫浸润模式及诊断模型构建的研究。结果发现 MDD 患者在多方面存在差异,构建的模型有良好预测性能,还找出潜在治疗靶点和药物,为诊疗提供新方向。
在当今社会,心理健康问题日益受到关注,重度抑郁症(MDD)作为一种常见且严重的精神疾病,给患者及其家庭带来了沉重的负担。MDD 的发病机制十分复杂,涉及遗传、环境等多种因素,目前其确切病因仍不明确。这使得在诊断和治疗方面面临诸多挑战,现有的治疗方法如药物治疗,虽有一定效果,但部分患者反应不佳,还存在副作用问题 ,因此迫切需要深入研究 MDD 的发病机制,寻找新的诊断和治疗策略。
在此背景下,川北医学院附属医院等机构的研究人员开展了相关研究。他们的研究成果发表在《Scientific Reports》上,为 MDD 的研究带来了新的曙光。
研究人员为了探究 MDD 的发病机制及其与免疫反应的关系,并寻找潜在治疗靶点,采用了多种关键技术方法。首先,从 Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获取 5 个符合条件的基因表达数据集,包括 GSE98793、GSE32280 等。运用基因集变异分析(GSVA)和 7 种免疫浸润算法,对 MDD 患者和健康对照者进行分析。通过 113 种机器学习方法构建 MDD 诊断模型,并对模型进行评估和验证。
下面来详细看看研究结果:
- MDD 患者信号和代谢通路异常:通过对多个基因集进行 GSVA 分析发现,MDD 患者在多个信号通路和代谢过程中表现异常。在基于 GO 基因集的 GSVA 分析中,与成骨细胞增殖、糖胺聚糖代谢等相关的信号通路异常活跃;基于 KEGG 基因集的分析显示,细胞黏附、转录失调等通路异常激活。在代谢方面,MDD 患者在糖胺聚糖、碳水化合物等代谢过程显著增强。
- MDD 患者免疫细胞浸润差异:利用 7 种免疫浸润算法评估发现,MDD 患者和健康个体的免疫细胞组成存在显著差异。健康个体外周血中 CD4+ T 细胞、CD8+ T 细胞等水平较高,而 MDD 患者外周血中巨噬细胞、M1 型巨噬细胞等水平明显升高,这表明 MDD 患者先天免疫反应相对活跃,适应性免疫反应较弱。
- 差异表达基因分析:综合分析 5 个数据集,共鉴定出不同数量的差异表达基因(DEGs)。通过交集分析,确定了 23 个核心基因(hub - genes),这些基因主要参与免疫和炎症过程,KEGG 通路分析显示它们在细胞因子 - 细胞因子受体相互作用等通路中富集。
- MDD 诊断模型构建与分析:使用 113 种机器学习算法,发现随机森林(RF)算法表现最佳,基于此算法确定了 6 个关键基因,构建了逻辑回归模型。该模型拟合良好,对 MDD 患者和健康对照者的区分能力较强,其诊断模型在多个数据集上的 AUC 值表明了良好的预测性能。
- MDD 诊断模型亚组分析:根据 MDD 模型得分中位数将患者分为高风险和低风险组。GSVA 分析显示,高风险组患者与免疫和炎症反应、氧化应激等功能异常相关。免疫浸润分析发现,高风险组中 CD8+ T 细胞等减少,中性粒细胞等增多,且一些免疫相关基因表达差异显著,表明先天免疫激活和适应性免疫减弱增加了 MDD 发病风险。
- MDD 潜在药物预测:通过 GSEA 方法分析高风险组上调的信号通路,确定了 5 个最显著上调的通路。利用相关数据库预测潜在药物,从 L1000 FWD 数据库获得 10 种可能有效的药物,从 CTRP 和 PRISM 数据集也预测出多种潜在药物,如 LY364947、vemurafenib 等,这些药物可能为 MDD 治疗提供新选择。
研究结论和讨论部分指出,该研究综合多方面分析,揭示了 MDD 复杂的发病机制。发现 MDD 患者存在异常活跃的信号和代谢通路,免疫细胞浸润模式也有差异,确定的核心基因和构建的诊断模型有助于 MDD 的诊断和风险分层。此外,找出的潜在治疗靶点和药物为开发新的治疗策略提供了方向。不过,研究也存在一些局限性,如样本量较小、未充分考虑混杂因素等。未来研究需要扩大样本量,纳入更详细的临床和人口统计学数据,以进一步深入了解 MDD 的分子机制,推动精准治疗的发展。总体而言,这项研究为 MDD 的研究和治疗开辟了新的道路,具有重要的理论和实践意义。