基于DNA与RNA测序技术解析BRAF融合结构变异及其在癌症精准治疗中的价值

【字体: 时间:2025年04月20日 来源:British Journal of Cancer 6.4

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   来自中国的研究团队针对癌症患者中BRAF融合的精准检测难题,通过DNA二代测序(NGS)和RNA-NGS技术,系统分析了371例FFPE样本,首次揭示了中国人群BRAF融合的分子特征:87.8%发生于胶质瘤,其中254例为常见KIAA1549-BRAF融合,66例罕见融合及18例特殊结构变异,并发现22种新型融合。研究证实RNA测序对融合转录本验证的关键作用,为优化NGS检测panel设计和靶向治疗提供了重要依据。

  

这项研究通过DNA二代测序(NGS)和RNA测序的联合分析,揭开了BRAF融合变异的神秘面纱。研究人员对中国癌症患者的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本进行检测,在371例阳性样本中发现有趣现象:87.8%的融合事件集中在胶质瘤领域。这些融合变异可划分为四大类型——254例常见型(以KIAA1549-BRAF为主)、66例罕见型、7例基因间区型和11例外显子型,它们在保留丝氨酸/苏氨酸受体酪氨酸激酶结构域(RTKD)的同时,展现出复杂的结构多样性。

RNA测序验证显示,常见融合组保持着稳定的转录模式,而其他组别则上演着分子生物学的"变奏曲":选择性剪接(alternative splicing)、反义重排(antisense rearrangement)和移码重排(frameshift rearrangement)等机制轮番登场。更有趣的是,33例缺失RTKD的融合变异和22种新型融合的发现,为癌症基因组图谱增添了新成员,这些变异分布在舌癌、肝癌、肺癌等多个癌种中。

该研究不仅为优化NGS检测panel提供了分子蓝图,更重要的是揭示了全面分子分型在BRAF融合阳性癌症靶向治疗中的指导价值,为精准医疗实践点亮了新的路标。

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