QMGBP-DL:深度学习与机器学习助力量子分子图带隙精准预测,推动药物与材料研发
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时间:2025年04月20日
来源:Molecular Diversity 3.9
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预测分子和量子材料性质(如带隙)对药物设计和材料科学意义重大。研究人员开展了 QMGBP-DL 研究,将分子图编码器与机器学习模型结合,在多个数据集上验证有效,比传统方法 MAE 更低,为带隙预测和材料研发提供有力支持。
预测分子和量子材料的性质,尤其是带隙,对于加速药物设计和材料科学领域的发现至关重要。尽管图神经网络和概率编码器在分子数据分析中已得到广泛应用,但它们针对带隙预测的集成与应用仍是一个活跃的研究领域。本文介绍了 QMGBP-DL,这是一种深度学习方法,它将分子图编码器与机器学习模型相结合,以提高分子和材料带隙能量的预测精度。编码器利用图卷积网络(GCN)从简化分子线性输入规范(SMILES)字符串中导出化学结构的潜在表示,并通过 Kullback–Leibler 散度损失进行优化。这些表示作为训练各种机器学习模型以预测性质的输入。使用 QM9、PCQM4M 和 OPV 数据集评估了 QMGBP-DL 的有效性,结果表明该方法有显著改进,特别是在使用随机森林模型进行性质预测时。与已有的 DenseGNN、MEGNet 和 ALIGNN 方法进行对比分析后发现,QMGBP-DL 在预测最高占据分子轨道(HOMO)、最低未占据分子轨道(LUMO)和带隙方面表现优异,实现了更低的平均绝对误差(MAE)值。将 GCN 导出的潜在空间与传统机器学习模型(尤其是随机森林)相结合,为带隙预测提供了一种强大的方法。研究结果突出了这种集成方法的有效性,表明基于图的分子编码与机器学习(特别是随机森林)相结合,对于准确的带隙预测非常有效,从而有助于材料的发现和设计。
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