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为探索胃癌（GC）预后生物标志物及发病机制，研究人员分析转录组测序数据。发现 25 个未报道基因，其中 ADAMTSL2 是 GC 预后独立预测因子，或参与 Notch 信号通路。为 GC 诊断、预后评估及治疗提供新方向。
胃癌，这个全球范围内常见的恶性肿瘤，一直是健康领域的重大挑战。在 2020 年，全球有超 100 万新发病例，其相关死亡率位居癌症死亡的第三位。尽管整体发病率和死亡率有所下降，但年轻人群（年龄 < 50 岁）的发病率却在上升。目前，早期胃癌的诊断依赖内镜和组织病理学检查，晚期则需要多种影像学技术辅助。虽然新型肿瘤诊断和预测技术不断涌现，如循环肿瘤细胞（CTCs）、外泌体和非编码 RNA（ncRNAs），但这些技术在胃癌临床实践中的应用仍处于实验阶段，尚未得到广泛认可。在治疗方面，靶向治疗和免疫治疗虽展现出一定前景，但晚期胃癌患者的生存率依旧不容乐观。因此，寻找新的诊断和预后生物标志物，对胃癌患者的综合管理至关重要。
为了攻克这些难题，福建医科大学附属第九〇〇医院（福州总医院临床医学院）肝胆外科的研究人员 Xiuling Zhu、Zhongyuan Cui 等人开展了相关研究，研究成果发表在《Discover Oncology》杂志上。
研究人员运用了多种关键技术方法。首先，从公共数据库（如 Gene Expression Omnibus、UCSC xena 数据库）获取胃癌患者肿瘤及癌旁组织的基因表达数据，包括微阵列数据和 TCGA STAD 数据。然后，利用在线工具 GEO2R 和 R 软件的 DESeq2 包等进行差异表达基因（DEGs）分析。此外，借助 Kaplan - Meier plotter 数据库进行生存分析，通过 The Human Protein Atlas 数据库检测蛋白质表达，运用多个数据库（如 miRWalk、cBioPortal、TIMER、TISIDB 等）及相关网络服务器（如 GEPIA）探索潜在病理机制 。
下面来看看具体的研究结果：
- 差异表达基因分析：研究人员分析 GSE113255、GSE122401 和 TCGA STAD 数据，找出在胃癌肿瘤和非肿瘤组织中差异表达的基因。三个数据集分析结果的交集显示，有 194 个基因上调，71 个基因下调。对上调基因进行 GO 和 KEGG 富集分析发现，这些基因主要富集在细胞外基质组织、PI3K - Akt 信号通路等。进一步在 PubMed 数据库检索，确定了 25 个此前未在胃癌研究中报道的上调基因。
- 具有预后价值和高蛋白质表达的基因：通过对这 25 个基因在胃癌中的预后价值分析，发现 11 个基因（ADAMTSL2、COL5A3、DSCC1 等）与胃癌患者的总生存期（OS）、首次进展生存期（FP）和进展后生存期（PPS）显著相关。其中，ADAMTSL2、COL5A3 等基因的 mRNA 高表达与患者预后不良有关，且这些基因在临床肿瘤标本中的蛋白质水平也有所升高。
- 临床病理相关性和多因素风险分析：整合 ADAMTSL2 等基因的 mRNA 表达与临床病理信息进行多因素风险分析。在 GSE84437 数据集分析中，发现 ADAMTSL2、年龄、T 和 N 分期是影响胃癌患者 OS 的独立危险因素；在 GSE26253 数据集分析中，高表达的 ADAMTSL2 mRNA 和病理分期是影响患者无复发生存期（RFS）的独立危险因素。
- ADAMTSL2 促进胃癌发生的潜在病理机制：预测潜在调控 ADAMTSL2 的 miRNA，发现 hsa - miR - 7 - 2 - 3p 可能与之相关，且低表达 hsa - miR - 7 的胃癌患者 OS 较差。此外，ADAMTSL2 与 Notch 信号通路中的关键分子（NOTCH1、NOTCH3、NOTCH4 和 HEY1）显著共表达，其在部分胃癌患者中存在突变，且与肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）有一定关联 。
在研究结论与讨论部分，研究人员发现了一组此前未在胃癌中报道的基因，并证明了它们的预后价值。其中，ADAMTSL2 是胃癌患者预后的独立危险因素，可能在胃癌的发生发展中起关键病理作用。这一发现为胃癌的诊断、预后评估和潜在治疗干预提供了新的方向。然而，研究也存在一定局限性，如仅对部分高蛋白质表达基因进行后续分析，对 ADAMTSL2 的功能和机制研究还不够全面。未来还需要进一步深入研究，以更全面地了解胃癌的发病机制，为临床治疗提供更有效的策略。
