miRNA 调控机制揭秘同源四倍体白菜光合优势,为作物育种点亮新光

【字体: 时间:2025年04月20日 来源:Plant Growth Regulation 3.5

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  为探究多倍体植物光合作用增强的分子机制,南京农业大学研究人员以白菜为材料,研究 miRNA 在其中的作用。结果发现 miRNA 调控 BcLhcbs 基因影响光合作用,该研究有助于理解多倍体光合调控,为白菜分子育种提供参考。

  在神奇的植物世界里,多倍体植物就像拥有特殊魔法的 “小巨人”,它们往往比二倍体祖先长得更壮、叶子更大,光合作用能力也更强。就拿我们常见的白菜来说,四倍体白菜的叶片明显更大,产量也更高,这背后似乎隐藏着一个关于光合作用的神秘密码。然而,一直以来,科学家们对多倍体植物光合作用增强的分子机制却知之甚少,这个未解之谜就像一层迷雾,笼罩在植物科学研究的领域。
为了揭开这层迷雾,探索多倍体植物光合作用的奥秘,南京农业大学的研究人员勇敢地踏上了探索之旅。他们以白菜(Brassica campestris ssp. chinensis)为研究对象,深入研究 miRNA(微小核糖核酸,一种参与基因表达调控的小分子 RNA)在其中发挥的作用。经过一系列复杂而严谨的实验,他们发现了关键的 miRNA - mRNA 模块,包括 novel - miR117 - BcLhcb1、novel - miR117 - BcLhcb4.2 和 Bc - miR403 - 5p - BcLhcb2.1。这些模块就像是一把把钥匙,开启了多倍体植物光合作用优势的大门。原来,多倍体化会降低 miRNA(如 novel - miR117 和 Bc - miR403 - 5p)的表达,从而减弱它们对 BcLhcbs(光系统 II 捕光叶绿素 a/b 结合蛋白基因家族)表达的抑制,最终让多倍体植物在光合作用上更具优势。这一发现意义重大,它不仅让我们更深入地理解了 miRNA 在多倍体植物光合作用中的调控机制,还为白菜等作物的分子育种开辟了新的方向,有望培育出更高产、更优质的作物品种。该研究成果发表在《Plant Growth Regulation》杂志上。

研究人员在此次研究中主要运用了以下关键技术方法:首先是转录组测序和小 RNA 测序技术,通过对二倍体和四倍体白菜的转录组和小 RNA 进行测序,分析基因表达差异和 miRNA 的调控作用;其次是病毒诱导基因沉默(Virus - induced gene silencing,VIGS)技术,用于沉默白菜中的 BcLhcbs 基因,研究其对光合作用的影响;最后是基因过表达技术,将 BcLhcbs 基因在拟南芥中过表达,观察其对植物生长和光合作用的作用 。

下面来详细看看研究结果:

  • 同源四倍体白菜生长和光合作用增强:研究发现,同源四倍体白菜植株和叶片更大,单株重量和比叶重(SLW)显著高于二倍体。四倍体白菜叶片可溶性糖含量约为二倍体的 1.4 倍,叶片更厚,细胞间隙更大。通过透射电镜观察发现,四倍体白菜叶绿体中淀粉颗粒更多,类囊体更厚且排列更有序,基粒厚度更大。同时,四倍体白菜的净光合速率(Pn)和最大光化学效率(Fv/Fm)显著增加,这些变化表明其光合作用能力增强。
  • 二倍体和四倍体白菜转录组分析:对二倍体和四倍体白菜进行转录组测序,结果显示测序数据重复性良好。差异分析发现,共有 2873 个差异表达基因,其中 1682 个上调,1191 个下调。KEGG 和 GO 分析表明,差异表达基因主要富集在光合作用相关途径,如光合作用 - 天线蛋白、叶绿体类囊体膜等,这与四倍体白菜光合作用增强的现象相符合。
  • 二倍体和四倍体白菜 miRNA 的鉴定:进行小 RNA 测序后,获得了高质量序列。共鉴定出 248 个 miRNA,包括 120 个已知 miRNA 和 128 个新预测的 miRNA。其中 40 个 miRNA 存在差异表达,26 个上调,14 个下调。对预测的靶基因进行 GO 和 KEGG 分析发现,靶基因主要富集在光合作用相关途径,进一步证明了 miRNA 在调控四倍体白菜光合作用中的重要作用。
  • miRNA 和转录组测序的综合分析:通过比较 miRNA 和转录组测序数据,确定了 162 个可能存在调控关系的 miRNA - mRNA 对,其中 87 对呈现负调控关系。在光合作用 - 天线蛋白途径中,发现 BcLhcb1、BcLhcb2.1 和 BcLhcb4.2 受特定 miRNA 调控,如 novel - miR117 负调控 BcLhcb1 和 BcLhcb4.2,Bc - miR403 - 5p 负调控 BcLhcb2.1。烟草瞬时表达实验验证了这些调控关系。
  • 沉默 BcLhcbs 降低白菜光合作用,过表达 BcLhcbs 增加拟南芥光合作用:利用 VIGS 技术沉默白菜中的 BcLhcbs 基因,结果显示沉默植株生长受到抑制,净光合速率显著降低。在拟南芥中过表达 BcLhcbs 基因,植株生长明显增加,重量显著提高,叶绿体超微结构分析发现转基因植株淀粉颗粒增大,类囊体排列更紧密有序。
  • miRNA(novel - miR117 和 Bc - miR403 - 5p)降低拟南芥植株重量:在拟南芥中过表达 novel - miR117 和 Bc - miR403 - 5p,在低光条件下,过表达植株生长明显受抑制,叶片更小,植株重量显著降低。分析发现,过表达植株中与 BcLhcbs 同源的 AtLhcbs 基因表达下调,且叶绿体超微结构发生变化,淀粉颗粒体积增大,但类囊体结构与对照组无明显差异。

研究结论和讨论部分表明,本研究揭示了 miRNA 参与同源四倍体白菜形成过程中的基因调控,从而增加了其光合能力,促进了植物生长。虽然研究取得了重要进展,但影响 miRNA 表达的调控机制仍不明确,需要进一步研究。总体而言,该研究为深入理解多倍体植物光合作用的分子机制提供了新的视角,为作物分子育种奠定了理论基础,对推动植物科学发展和农业生产具有重要意义。

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