靶向 CD64 适体的体外筛选及其相互作用分子机制解析:为脓毒症诊断试剂研发开辟新径

【字体: 时间:2025年04月19日 来源:Indian Journal of Microbiology 2.1

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  脓毒症(Sepsis)发病率和死亡率高,早期诊断困难。研究人员开展了针对人中性粒细胞 CD64(nCD64)的适体筛选及作用机制研究。经 8 轮筛选获得 3 个关键适体,为其作为 nCD64 诊断试剂提供依据,奠定了诊断试剂研发基础。

  脓毒症(Sepsis)是由各种细菌感染引起的全身炎症反应综合征(SIRS),在全球范围内仍是一个严重的健康问题,发病率和死亡率都很高,而早期诊断和鉴别诊断仍然是一项挑战。人中性粒细胞 CD64(nCD64,也称为 FcγRI)是免疫球蛋白(Ig)超家族的跨膜糖蛋白,它能与抗体特定部分的 Fc(恒定)区域高亲和力结合。CD64 是脓毒症早期诊断和预后的一种新的特异性敏感生物标志物。本研究旨在通过一种称为指数富集配体系统进化(SELEX)的新型体外筛选技术,筛选出对人 CD64 具有高亲和力和特异性的适体,并揭示适体与靶标相互作用的分子机制。将固定在羧酸磁珠上的人 CD64 作为靶标,通过 SELEX 技术进行 8 轮筛选。运用生物信息学分析对适体的二级结构进行预测、家族分类以及 KD 值测定,从而确定关键适体。然后进行分子对接模拟和分子动力学模拟,以揭示适体与靶标相互作用的分子机制。经过 8 轮筛选以及聚合酶链式反应(PCR)优化后,获得了 3 个关键适体。生物信息学分析表明,茎环结构和 G - 四链体是针对 CD64 的适体的主要预测二级结构,这表明了适体与 CD64 之间的潜在结合位点,并且 G-T 错配很常见。利用基于深度学习的结构预测方法,获得了可靠的适体三维模型,揭示了茎环和内环等独特的结构基序。对接结果显示出有利的结合构象,适体与 CD64 结合位点的静电势在形状上相互匹配。模拟结果表明复合物具有收敛性和稳定性,相对较低的均方根偏差值和波动情况就是证明。对接构象和分子动力学结果之间的一致性增强了预测的适体 - CD64 相互作用的可靠性。经过 8 轮筛选获得了 3 个关键适体。研究结果为这 3 个关键适体的结构特征和结合特性提供了有价值的见解,支持它们作为 CD64 诊断试剂的潜力。本研究为这些适体在诊断试剂开发中的进一步实验验证和优化奠定了基础。
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