探秘多发性骨髓瘤(MM):CAV1、CD44 和 TFRC—— 潜在的诊断标志物与治疗新靶点
【字体:
大
中
小
】
时间:2025年04月19日
来源:Cell Biochemistry and Biophysics 1.8
编辑推荐:
多发性骨髓瘤(MM)恶性程度高、生存率低,其预后标志物的研究意义重大。研究人员针对 FRGs 在 MM 中的作用开展研究,筛选出 17 个关键基因,其中 CAV1、CD44 和 TFRC 与 MM 预后相关,有望成为预后标志物和治疗靶点,改善患者预后。
多发性骨髓瘤(Multiple Myeloma,MM)是一种恶性程度很高的血液肿瘤,总体生存率较低。因其复杂且具有异质性,寻找新的预后标志物至关重要。铁死亡(Ferroptosis)是一种由脂质过氧化驱动的铁依赖性细胞死亡方式,在肿瘤的发展和进程中起着关键作用。因此,铁死亡相关基因(Ferroptosis-related genes,FRGs)有望成为有前景的治疗靶点和预后指标。然而,FRGs 在 MM 中的具体作用和预测价值仍不明确。本研究旨在探究 FRGs 在 MM 中的潜在作用。FRGs 数据来自 FerrDb 资源,基因表达数据来自基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中的 GSE133346 和 GSE166122 数据集,涵盖了健康个体和 MM 患者。利用 R 语言中的 limma 和 DESeq2 软件包识别差异表达的 FRGs(Differentially expressed-FRGs,DE-FRGs)。通过基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,研究相关功能通路。借助 miRWalk 数据库进行 miRNA 与关键基因的关联及富集分析。采用 Kaplan-Meier 生存分析评估与预后相关的基因。研究人员共识别出 1400 个差异表达基因,经与 FRGs 交叉比对,最终筛选出 17 个 DE-FRGs 或关键基因。GO 分析显示,这些关键基因主要富集于姐妹染色单体分离、浓缩染色体着丝粒区域、C-C 趋化因子受体活性以及 C-C 趋化因子结合等功能。KEGG 通路分析表明,这些重叠基因在细胞周期、病毒蛋白与细胞因子及细胞因子受体的相互作用,以及乳腺癌和前列腺癌相关通路中富集。此外,基于 miRNA 与候选基因的关联,在糖酵解、糖异生和柠檬酸循环通路中也观察到显著富集。基于多资源的蛋白质 - 蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)分析,确定 CAV1、CD44、TFRC、DPP4 和 GJA1 为排名前五的关键 DE-FRGs。生存分析最终确定 CAV1、CD44 和 TFRC 是与总生存期相关的排名靠前的 DE-FRGs,凸显了它们在 MM 中的重要作用。本研究确定 CAV1、CD44 和 TFRC 是与 MM 预后相关的关键 FRGs,表明它们有望成为有价值的预后标志物和治疗靶点,从而改善患者的预后。
生物通微信公众号
生物通新浪微博
今日动态 |
人才市场 |
新技术专栏 |
中国科学人 |
云展台 |
BioHot |
云讲堂直播 |
会展中心 |
特价专栏 |
技术快讯 |
免费试用
版权所有 生物通
Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved
联系信箱:
粤ICP备09063491号