基于环状 RNA(circRNA)的非小细胞肺癌(NSCLC)生物标志物鉴定及 ceRNA 机制探索
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时间:2025年04月19日
来源:Cell Biochemistry and Biophysics 1.8
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为探究非小细胞肺癌(NSCLC)中 circRNA 作为生物标志物的作用及潜在机制,研究人员从 GEO 数据库获取 circRNA 和 mRNA 数据开展研究。结果鉴定出 5 个 circRNA 可作 NSCLC 生物标志物,构建了 ceRNA 网络,该研究为后续机制探索提供帮助。
研究旨在鉴定非小细胞肺癌(NSCLC)中 circRNA 作为生物标志物的作用,并探索其潜在机制。从 GEO 数据库获取 circRNA 和 mRNA 数据,运用一系列生物信息学分析方法,包括差异表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、随机森林和支持向量机算法,来识别 NSCLC 中的关键 circRNA。通过 ROC 曲线评估关键 circRNA 在癌症中的作用。利用 qPCR 分析验证 circRNA 的表达水平。最后构建了 ceRNA 网络。在此,将 si-hsa_circ_0084443 转染到 NSCLC 细胞中,以研究其在 NSCLC 中的功能。鉴定出 5 个 circRNA(hsa_circ_0049271、hsa_circ_0029426、hsa_circ_0084443、hsa_circ_0015278 和 hsa_circ_0024731)作为 NSCLC 的生物标志物。它们在识别 NSCLC 方面具有强大的诊断能力,AUC>0.85。qPCR 结果表明,与正常组织相比,hsa_circ_0049271、hsa_circ_0029426 和 hsa_circ_0015278 在肿瘤组织中显著下调,而 hsa_circ_0084443 和 hsa_circ_0024731 显著上调(P<0.05)。最终构建了 ceRNA 网络。敲低 hsa_circ_0084443 可抑制 NSCLC 细胞系的细胞生长、迁移、侵袭和集落形成,并促进细胞凋亡。鉴定出 5 个 circRNA 作为生物标志物,在 NSCLC 中表现出异常表达。此外,构建的 ceRNA 网络有助于未来的机制探索。
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