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这篇综述聚焦人工智能(AI)在罕见病领域的应用,以法布里病为例,探讨了机器学习(ML)和深度学习(DL)等方法。AI 有助于罕见病诊断、病情监测和个性化治疗,但也面临数据稀缺、可解释性等挑战,强调需合理监管与人为监督。
人工智能技术概述
人工智能(AI)能让计算机模拟人类智能,执行复杂任务。机器学习(ML)是 AI 的子集,深度学习(DL)又是 ML 的子集,涉及更多参数。ML 有监督学习、无监督学习和强化学习三种方法。监督学习用 “标记数据” 训练模型,分为回归和分类;无监督学习可识别 “未标记数据” 的模式;强化学习通过试错和反馈改进决策。DL 基于人工神经网络(ANN),用于复杂问题和大规模数据分析,可进行图像和文本分析等。多种 ML 和 DL 方法可结合,形成多模态方法,提高结果准确性。
罕见病现状及 AI 的作用
在欧盟,患病率≤1/2000 的疾病被定义为罕见病;在美国,影响人数少于 20 万的疾病或病症为罕见病。全球约 3 亿人受罕见病影响,已确认超 10,000 种罕见病,给医疗带来挑战。罕见病患者从出现症状到确诊往往耗时久,原因包括医生认知不足、临床症状不典型、遗传异质性等。诊断延误使患者面临误诊、无效治疗等问题,还会加重病情。法布里病(Fabry disease)是一种 X 连锁隐性遗传的罕见病,由编码 α - 半乳糖苷酶 A(α -Gal A)的 GLA 基因突变引起,会导致多器官损伤。AI 技术有助于加速罕见病诊断,预测疾病进展,确定合适治疗策略,还能辅助罕见病的鉴别诊断。
文献检索方法
通过 PubMed 在线搜索引擎,用 AI、法布里病、罕见病等相关关键词组合检索 Medline 数据库,检索截至 2025 年 1 月 8 日,去除重复和不相关文章。再用 AI 与法布里病受累器官相关关键词、AI 和罕见病关键词(限定 2021 年 1 月 1 日至 2023 年 12 月 31 日发表的文章)进行补充检索,最终确定 20 篇文章纳入综述。
人工智能在罕见病中的应用
AI 在罕见病领域应用广泛,主要用于辅助诊断,可前瞻性识别潜在患者,也可回顾性诊断被忽视的罕见病。
- 前瞻性方法
- 新生儿基因组筛查:Screen4Care 项目通过对大量欧洲新生儿进行下一代测序(NGS),结合电子健康记录(EHR)筛查,加速罕见病诊断。但新生儿诊断存在伦理争议,晚发型法布里病等疾病的筛查时机需谨慎考虑,而经典型法布里病患者可从早期诊断和治疗中获益。
- 医院电子健康记录筛查:利用医院 EHR 中的数据,通过命名实体识别(NER)提取表型和临床症状,再进行标准化处理,计算患者与疾病的表型距离,辅助医生诊断。美国和波兰的研究团队已开发出相关 ML 方法,用于检测未确诊的法布里病患者。大语言模型(LLMs)的出现为文本数据利用提供新视角,可用于检测临床记录中的异常表型。
- 回顾性以患者为中心的方法
- 基因变异识别:对疑似罕见病患者进行基因组测序,如全外显子测序(WES)或全基因组测序(WGS),会产生大量数据。AI - 基于的变异优先级排序工具可帮助识别致病基因变异,如 De La Vega 等人开发的方法,结合患者表型,能实现自动诊断提名。DL 算法可评估法布里病变异的致病性,结合多组学方法有助于开发个性化疗法。
- 临床特征分析:利用 AI 面部识别技术,如 DeepGestalt,可辅助罕见病诊断。法布里病患者的面部特征有助于诊断,且此类技术使用越多,性能越好。心脏功能和形态的异常可通过心电图(ECG)和心脏成像检测,AI 工具能辅助分析。如特定的 ECG 参数可预测法布里病,结合心血管磁共振成像(cMRI)和 ML 方法能更好地诊断心肌病。脑病变的 MRI 分析可用于鉴别疾病,DL 脑年龄模型可评估法布里病患者的脑老化情况,辅助临床监测和药物开发。眼部成像可用于疾病早期诊断,DL - 基于的 CNN 算法可进行视网膜或黄斑分割。法布里病患者的眼部特征可通过 ML 自动检测,相关算法还可用于其他罕见病的诊断。听力损失和耳鸣是法布里病的常见症状,ML 方法可用于自动评估和预测,AI 耳鸣功能指数可评估疾病进展或治疗效果。AI 技术可辅助皮肤病诊断,对法布里病患者的血管皮肤病变(血管角质瘤)诊断有潜在帮助,有望与其他 ML 诊断方法结合。
人工智能在罕见病应用中的益处、挑战、局限及未来展望
- 益处:AI 技术能整合大量数据,辅助医生诊断,其准确性有时优于专家。多模态 ML 模型结合多种数据,可提高诊断准确性。预测计算模型推动医学数字孪生概念发展,有助于个性化医疗。AI 还可用于远程监测患者生理指标,为 “医院在家” 计划提供支持。
- 挑战和局限:AI 模型训练依赖精心设计的数据集,数据稀缺限制其在罕见病中的应用。AI 技术存在可解释性问题,包括算法不透明、模型可靠性和结果解释等。此外,AI 项目实施成本高,医疗记录缺乏连续性等问题也阻碍其广泛应用。
- 未来展望:随着技术发展,AI 有望在罕见病诊断、治疗和监测方面发挥更大作用。国际上需建立算法互操作性标准,促进数据共享和合作。
人工智能应用中的患者保护
AI 使用涉及患者隐私、安全等问题。欧盟的 “AI Act” 和美国的相关行政命令,以及世界卫生组织(WHO)的 AI 伦理和治理指南,都强调了人为监督的重要性。医疗专业人员有责任告知患者数据使用情况,确保数据匿名化,并在患者管理中发挥主导作用。
人工智能对罕见病管理的影响
AI 可分析患者的基因组、生理、影像和 EHR 数据,辅助诊断。多模态 AI 方法有助于快速准确诊断罕见病,启动适当治疗,监测疾病进展。AI 还能帮助医生节省时间,更好地了解疾病自然史,尤其对法布里病等罕见病的诊断有重要意义。
结论
AI 有助于减少罕见病误诊,缩短诊断时间,改善患者健康状况。利用 EHR、医学影像和 DNA 测序数据,结合多模态 AI 方法,可加速罕见病诊断,但不能替代医疗专业人员的判断。同时,需关注 AI 应用的伦理问题,在创新与监管间寻求平衡。