解析多种疾病转录组学：免疫系统通路在视网膜损伤修复与神经再生中的核心意义

为解决急性视网膜损伤缺乏有效临床治疗的问题，研究人员利用视神经挤压（ONC）、急性眼压（IOP）升高和视神经局部注射脂多糖（LPS）等模型开展研究。结果发现免疫系统通路是共同靶点，且 Ccl5 是关键基因。这为治疗急性视网膜损伤提供重要依据。

　　视网膜神经节细胞（Retinal ganglion cells，RGCs）是连接视网膜输入与大脑视觉处理中心的唯一神经元桥梁，能实现视觉感知。RGCs 的轴突构成视神经，将视觉信息传递至视觉皮层。RGCs 及其轴突受损会导致不可逆的视力损害。急性视网膜损伤通常由视神经压迫、青光眼和视神经炎等引起，目前尚无有效的临床治疗方法。因此，了解 RGCs 及其轴突对损伤的反应，对开发潜在治疗方法至关重要。本研究利用多种模型，包括视神经挤压（ONC）、急性眼压（IOP）升高和视神经局部注射脂多糖（LPS）来模拟眼部疾病。术后三天，分离小鼠视网膜，进行批量 RNA 测序，分析不同模型间的差异基因表达。以 | Log₂ 倍数变化（FC）|> 2 且 p 值 < 0.05 为阈值，各模型中观察到的显著基因表达变化如下：ONC（上调 456 个；下调 84 个），IOP（上调 1946 个；下调 655 个），LPS（上调 219 个；下调 94 个）。对上调基因的基因本体（GO）分析意外发现，免疫系统通路是所有三个模型的主要共同靶点。相比之下，下调基因表现出模型特异性富集：IOP 中是突触成分和功能，ONC 中是神经发生和神经元发育，LPS 中是炎症和抗氧化。京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析进一步证实了这些发现。这表明控制免疫激活对治疗急性视网膜损伤至关重要，治疗策略也应针对模型特异性靶点。值得注意的是，三个模型中有 39 个基因交叉，蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络确定 Ccl5 为关键枢纽基因，突出了其在三种疾病病理生理学中的关键作用。