改写调控 DNA：剖析与重编程基因表达的新突破

为解决调控 DNA 序列的作用及可编程性难以绘制和预测的问题，研究人员开展了名为 Variant-EFFECTS 的研究。他们对 2 种细胞类型中 2 个基因的 3 个调控元件进行剖析和重编程，揭示相关特性及模型局限，为基于引导编辑（prime - editing）的疗法提供可能。

　　调控 DNA 为转录因子结合提供平台，用于编码细胞类型特异性的基因表达模式。然而，调控 DNA 序列的作用和可编程性仍难以绘制或预测。研究人员开发了 Variant-EFFECTS（通过 CRISPR 靶向筛选的流式分选实验产生的变异效应）技术，对内源性调控 DNA 引入数百个设计好的编辑，并量化它们对基因表达的影响。研究系统剖析并重新编程了 2 种细胞类型中 2 个基因的 3 个调控元件。这些数据揭示了具有特定基因组环境效应的内源性结合位点、具有细胞类型特异性活性的转录因子基序，以及预测变异效应大小的计算模型的局限性。研究人员还发现了能在大动态范围内调节基因表达的小编辑，这为靶向调控 DNA 的基于引导编辑（prime - editing）的疗法提供了新的可能性。Variant-EFFECTS 为剖析调控 DNA 以及识别在内源环境中调节基因表达的基因组编辑试剂提供了一种通用工具。