小热休克蛋白客户隔离机制与诱导多分散性的结构解析

《Nature Communications》:

【字体: 时间:2025年04月17日 来源:Nature Communications

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  编辑推荐:为阐明sHSPs(small heat shock proteins)如何通过动态多聚体组装捕获变性蛋白客户(client),研究人员通过高分辨率冷冻电镜(cryo-EM)解析了Methanocaldococcus jannaschii的sHSP(mjHSP16.5)在apo状态及客户结合状态下的结构,揭示了NTD(N-terminal domain)和CTD(C-terminal domain)介导的“极化组装”机制,为蛋白质错误折叠疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病)的干预策略提供新靶点。

  在细胞面临热应激或氧化损伤时,蛋白质错误折叠和聚集是导致阿尔茨海默病、帕金森病等神经退行性疾病的关键因素。小热休克蛋白(sHSPs)作为细胞内的“第一响应者”,能通过ATP非依赖的“holdase”机制捕获变性蛋白客户(client),防止其聚集。然而,sHSP/client复合物的极端结构可塑性和多分散性长期阻碍其分子机制的解析。来自美国俄勒冈健康与科学大学的研究团队以超嗜热古菌Methanocaldococcus jannaschii的sHSP(mjHSP16.5)为模型,通过高分辨率冷冻电镜(cryo-EM)首次捕获了apo状态及客户(溶菌酶)结合状态下的多聚体结构 ensemble,相关成果发表于《Nature Communications》。

研究采用冷冻电镜单颗粒分析(single-particle cryo-EM)、3D变异性分析(3DVA)、动态光散射(DLS)和负染电镜(NS-EM)等技术,结合NTD苯丙氨酸(Phe)突变体(mj-1x/mj-3x/mj-6x)的功能验证,系统阐明了sHSP的组装与客户捕获机制。

Structural plasticity of the mjHSP16.5 apo-state is coupled to the NTD
研究发现,mjHSP16.5的apo状态存在收缩(2.50 ?)和扩展(2.35 ?)两种24聚体笼状结构,其动态性主要由NTD的螺旋-转角-β片层拓扑驱动。温度升至75°C仅轻微增加NTD灵活性,表明该古菌sHSP的激活依赖亚基交换而非整体构象重排。

Conserved phenylalanine-rich regions of the NTD mediate oligomeric assembly and stability
NTD的芳香区(Phe2/7/11)和保守区(Phe15/18/19)突变实验显示,6个Phe同时突变(mj-6x)会导致寡聚体解聚为环状或纤维网络,证实这些残基通过疏水效应维持24聚体稳定性。

Client-induced polydispersity of mjHSP16.5
溶菌酶结合后,sHSP复合物流体力学半径(Rh)从6.0 nm(apo)增至8.5 nm,负染电镜显示其形态从均一笼状变为延展簇状,多分散性显著增加(p<0.0005)。

Cryo-EM resolved an ensemble of chaperone/client complexes
冷冻电镜解析出24-mer(2.6 ?)、26-mer(3.7 ?)、32-mer(4.4 ?)、34-mer(4.7 ?)和36-mer(4.0 ?)五种客户结合状态。其中26-mer通过4-fold窗口/3-fold轴的新几何特征实现亚基插入,内部空腔容积扩大至100 nm3(可容纳1个溶菌酶),而36-mer容积达140 nm3(理论可结合6个客户)。

CTD flexibility enables client-induced sHSP polydispersity
比较结构显示,CTD的IXI基序存在“向上”和“向下”两种构象(偏差达10 ?),通过动态拴系ACD二聚体形成4-fold窗口或5-fold轴等非经典几何特征,而ACD二聚体界面(112-133 ?2)和ACD/CTD相互作用(644-669 ?2)保持稳定,证实sHSP的多分散性源于CTD柔性而非核心破坏。

Client-induced sHSP polarized destabilization directs chaperone elongation
局部分辨率分析发现,客户结合后26-mer的4-fold轴附近分辨率最高(3-4 ?),沿延伸支架递减至9-10 ?,表明客户通过局部去稳定化驱动“极化组装”——即亚基/client单元沿极性方向逐步插入。

该研究提出“极化组装”和“种子组装”双模型,揭示了sHSP通过NTD/CTD协同作用实现客户捕获的分子逻辑。其意义在于:(1)为sHSP在神经退行性疾病、白内障等病理中的作用提供结构基础;(2)阐明多分散性增强客户容量的物理机制;(3)靶向NTD保守Phe或CTD动态性可能成为干预蛋白质聚集疾病的新策略。

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